荧光PCR-优化寡核苷酸探针法与Sanger测序法检测肺癌、结直肠癌患者KRAS基因突变的对比分析

被引：2

作者：

邱田 ^{[1
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凌云 ^{[1
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陈钊 ^{[2
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山灵 ^{[1
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郭蕾 ^{[1
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吕宁 ^{[1
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应建明 ^{[1
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机构：

[1] 中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科

[2] 清华大学生命科学学院

来源：

中华病理学杂志 | 2012年 / 09期

关键词：

结直肠肿瘤; 肺肿瘤; DNA突变分析; 聚合酶链反应; 序列分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

R734.2 [肺肿瘤]; R735.3 [肠肿瘤];

学科分类号：

100112 [医学生物化学与分子生物学]; 100117 [系统生物医学];

摘要：

目的对荧光PCR-优化寡核苷酸探针法与Sanger测序法检测肺癌、结直肠癌患者KRAS基因突变阳性率、符合率进行对比分析,探讨荧光PCR-优化寡核苷酸探针法检测KRAS基因突变的临床应用特点。方法收集221例肺腺癌、131例结直肠癌标本。所有标本均经4%中性甲醛固定、石蜡包埋、组织切片后评估肿瘤细胞含量,必要时行刮取富集肿瘤细胞后提取基因组DNA,采用荧光PCR-优化寡核苷酸探针法及Sanger测序法检测标本中KRAS基因突变。统计两种方法检测突变阳性率、突变类型、与患者特征相关性及符合率等。结果 221例肺癌标本中通过荧光PCR-优化寡核苷酸探针法及Sanger测序法检出KRAS基因突变阳性率分别为6.3%(14/221)、4.5%(10/221);131例结直肠癌标本中检出KRAS基因突变阳性率分别为41.2%(54/131)、40.5%(53/131),不论何种方法检测KRAS基因突变阳性率均与患者性别、年龄无关(P>0.05)。两种方法检测KRAS基因突变的阳性率差异无统计学意义(P>0.05)。结直肠癌KRAS基因突变率显著高于肺癌(P<0.01)。KRAS基因第12位密码子突变比例显著高于第13位密码子(P<0.05)。两种方法检测结果总体符合率为97.4%。结论荧光PCR-优化寡核苷酸探针法检测肺癌、结直肠癌患者KRAS基因突变检出率与Sanger测序法相当,可作为Sanger测序法之外的基因突变检测的备选方法。

引用