大白菜SSR检测体系的优化

被引：18

作者：

石磊 ^{[1
]}

李丽 ^{[2
]}

郑晓鹰 ^{[2
]}

机构：

[1] 甘肃农业大学草业学院

[2] 北京市农林科学院蔬菜研究中心

来源：

分子植物育种 | 2007年 / 01期

关键词：

大白菜; SSR; 检测体系; 优化; SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳;

D O I：

暂无

中图分类号：

S634.1 [大白菜];

学科分类号：

摘要：

以不同地区栽培的5份大白菜品种为试材,从PCR反应组成、扩增程序、电泳检测等环节对SSR技术进行了优化,建立了一套适用于大白菜品种鉴定的SSR-PCR体系。即10μL反应组成为:1×buffer;2.50mmol/LMgCl2;0.10mmol/LdNTPs;0.35μmol/LSSR引物;1.00ng/μL模板DNA和0.40UTaq酶。适宜的扩增程序为72℃热启动3min,94℃预变性2min后进行20个迫降循环:94℃变性60s,68℃退火60s,72℃延伸45s(-1℃/2cycles);再进行20个循环:94℃变性60s,58℃退火60s,72℃延伸45s,72℃延伸10min。应用SDS-聚丙烯酰胺凝胶(银染)电泳检测并取得很好的效果。选用108对芸薹属SSR引物,对这5份品种的基因组进行扩增,筛选出具有2条以上特异扩增条带的SSR引物22对。用这些引物对5份品种进行扩增,初步分析了SSR标记的多态性及用于大白菜指纹分析的潜力。

引用

页码：110 / 116

页数：7

共 10 条

[1] 甘蓝型油菜产量及其构成因素的QTL定位与分析
张书芬
傅廷栋
朱家成
王建平
文雁成
马朝芝
[J]. 作物学报, 2006, (08) : 1135 - 1142
[2] 甘蓝型油菜SRAP、SSR、AFLP和TRAP标记遗传图谱构建
金梦阳
刘列钊
付福友
张正圣
张学昆
李加纳
[J]. 分子植物育种, 2006, (04) : 520 - 526
[3] 甘蓝型油菜中油杂8号种子纯度的SSR鉴定
梅德圣
李云昌
胡琼
李英德
徐育松
[J]. 中国农学通报, 2006, (05) : 49 - 52
[4] 甘蓝型油菜黄籽品种SSR指纹图谱的构建
雷天刚
张学昆
陆合
李加纳
徐新福
范其新
谌利
[J]. 西南农业大学学报(自然科学版), 2005, (03) : 361 - 364
[5] 甘蓝型油菜杂交种亲本的遗传多样性评价
周国岭
刘平武
杨光圣
傅廷栋
不详
[J]. 中国农业科学 , 2004, (11) : 1766 - 1771
[6] Isolation and characterization of microsatellites in Brassica rapa L[J] . K. Suwabe,H. Iketani,T. Nunome,T. Kage,M. Hirai.Theoretical and Applied Genetics . 2002 (6-7)
[7] Microsatellite markers for genome analysis in Brassica. II. Assignment of rapeseed microsatellites to the A and C genomes and genetic mapping in Brassica oleracea L[J] . B. Saal,J. Plieske,J. Hu,C. F. Quiros,D. Struss.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2001 (5)
[8] Microsatellite markers for genome analysis in Brassica. I. development in Brassica napus and abundance in Brassicaceae species[J] . J. Plieske,D. Struss.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2001 (5)
[9] Diversity of microsatellites derived from genomic libraries and GenBank sequences in rice (Oryza sativa L.)[J] . Y. G. Cho,T. Ishii,S. Temnykh,X. Chen,L. Lipovich,S. R. McCouch,W. D. Park,N. Ayres,S. Cartinhour.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2000 (5)
[10] Identification of polymorphic, conserved simple sequence repeats (SSRs) in cultivated Brassica species[J] . A. K. Szewc-McFadden,S. Kresovich,S. M. Bliek,S. E. Mitchell,J. R. McFerson.Theoretical and Applied Genetics . 1996 (4)

← 1 →