用生物信息学手段辅助分析猪瘟病毒的基因结构

被引：3

作者：

范学政

王琴

宁宜宝

王在时

机构：

[1] 中国兽医药品监察所

[2] 中国兽医药品监察所北京

[3] 北京

来源：

中国预防兽医学报 | 2004年 / 01期

关键词：

猪瘟病毒; 序列分析; 抗原性; 非编码区;

D O I：

暂无

中图分类号：

S852.651 [];

学科分类号：

090601 ;

摘要：

借助生物信息软件,对猪瘟病毒的分子演化关系、RNA3'端非编码区(NTR)序列及二级结构、E2基因的亲水性及抗原指数等进行了辅助分析。经检索得到CSFV全长序列23条,序列片段369条。确定了AF352565(LPC)株的碱基缺失在ORF的1174～1176位。采用基因组序列的全长ORF进行了比对并绘制了进化树,对E2基因的亲水谱与抗原指数进行计算,推测E2基因抗原性变化不大,但不同毒株之间可能存在微小差异。比较了CSFV3'端NTR的序列并预测了3'端NTR的RNA二级结构,表明不同毒株之间存在较多差异。

引用

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共 7 条

[1] 猪瘟病毒保护性抗原E2蛋白单抗的制备及其抗原表位的初步分析 [J].