几种水稻田土壤微生物总DNA提取方法的比较

被引:19
作者
顾华杰
李玉祥
赵明文
潘根兴
机构
[1] 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
[2] 南京农业大学农业资源与生态环境研究所 江苏南京
[3] 江苏南京
关键词
水稻田土壤; 微生物; 方法比较; DNA提取;
D O I
10.13312/j.issn.1671-7783.2005.04.008
中图分类号
S154.34 [土壤微生物生物物理、生化与生理];
学科分类号
071012 ; 0713 ;
摘要
目的:使人们在提取土壤总DNA时,可以根据不同的要求选用不同的方法。方法:选用了5种现在较常用的土壤微生物总DNA提取方法从水稻田土壤中提取总DNA,并对5种方法提取的DNA的质量和数量进行比较评价。结果:5种方法都可以从土壤中提取到长度大于48 kb的DNA片段,但不同方法提取的DNA的产量存在明显差异。土壤总DNA都不需要纯化就可以用于PCR扩增,使用细菌16S rDNA基因的引物可以扩增得到相应的片段。结论:Bourrain法和M artin-Laurent法可以较快地提取出DNA,M artin-Laurent法提取的DNA的量最多,Tied je法和Jans-sen法提取的DNA片段最大,Janssen法提取的DNA纯度最高,Reddy法提取的DNA的完整性和PCR扩增效果最好。
引用
收藏
页码:300 / 305
页数:6
相关论文
共 10 条
[1]   分子生物学方法在污染土壤微生物多样性研究中的应用 [J].
李慧 ;
陈冠雄 ;
张颖 ;
张成刚 .
土壤学报, 2004, (04) :612-617
[2]   土壤微生物多样性研究的新方法 [J].
马万里 ;
Josquin Tibbits ;
Mark Adams .
土壤学报, 2004, (01) :103-107
[3]   深海沉积物中微量DNA的提取及应用 [J].
赵晶 ;
张锐 ;
林念炜 ;
曾润颖 .
海洋与湖沼, 2003, (03) :313-321
[4]   土壤微生物总DNA的提取和纯化 [J].
张瑞福 ;
曹慧 ;
崔中利 ;
李顺鹏 ;
樊奔 .
微生物学报, 2003, (02) :276-282
[5]   几种直接从高温热泉沉积物中提取DNA方法之比较 [J].
王涛 ;
柴丽红 ;
郭春雷 ;
崔晓龙 ;
徐丽华 ;
彭谦 ;
姜成林 .
生物技术, 2003, (01) :17-18
[6]   新鲜肿瘤标本活细胞与固定细胞的DNA含量分析比较 [J].
陶德定 ;
冷彦 ;
覃吉超 ;
余源 ;
龚建平 .
癌症, 2001, (05) :502-504
[7]   土壤微生物生物量作为红壤质量生物指标的探讨 [J].
俞慎 ;
李勇 ;
王俊华 ;
车玉萍 ;
潘映华 ;
李振高 .
土壤学报, 1999, (03) :413-422
[8]   分子生物学方法在微生物生态学中的应用 [J].
夏北成 .
中山大学学报(自然科学版), 1998, (02) :98-102
[9]  
生物化学与分子生物学实验常用数据手册[M]. 科学出版社 , 吴冠芸等主编, 1999
[10]   DNA extraction from activated sludges [J].
Bourrain, M ;
Achouak, W ;
Urbain, V ;
Heulin, T .
CURRENT MICROBIOLOGY, 1999, 38 (06) :315-319