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几种水稻田土壤微生物总DNA提取方法的比较
被引:19
作者
:
顾华杰
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机构:
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
顾华杰
李玉祥
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机构:
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
李玉祥
赵明文
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机构:
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
赵明文
潘根兴
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机构:
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
潘根兴
机构
:
[1]
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
[2]
南京农业大学农业资源与生态环境研究所 江苏南京
[3]
江苏南京
来源
:
江苏大学学报(医学版)
|
2005年
/ 04期
关键词
:
水稻田土壤;
微生物;
方法比较;
DNA提取;
D O I
:
10.13312/j.issn.1671-7783.2005.04.008
中图分类号
:
S154.34 [土壤微生物生物物理、生化与生理];
学科分类号
:
071012 ;
0713 ;
摘要
:
目的:使人们在提取土壤总DNA时,可以根据不同的要求选用不同的方法。方法:选用了5种现在较常用的土壤微生物总DNA提取方法从水稻田土壤中提取总DNA,并对5种方法提取的DNA的质量和数量进行比较评价。结果:5种方法都可以从土壤中提取到长度大于48 kb的DNA片段,但不同方法提取的DNA的产量存在明显差异。土壤总DNA都不需要纯化就可以用于PCR扩增,使用细菌16S rDNA基因的引物可以扩增得到相应的片段。结论:Bourrain法和M artin-Laurent法可以较快地提取出DNA,M artin-Laurent法提取的DNA的量最多,Tied je法和Jans-sen法提取的DNA片段最大,Janssen法提取的DNA纯度最高,Reddy法提取的DNA的完整性和PCR扩增效果最好。
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相关论文
共 10 条
[1]
分子生物学方法在污染土壤微生物多样性研究中的应用
[J].
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机构:
李慧
;
陈冠雄
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中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室
陈冠雄
;
张颖
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中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室
张颖
;
张成刚
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机构:
中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室
张成刚
.
土壤学报,
2004,
(04)
:612
-617
[2]
土壤微生物多样性研究的新方法
[J].
马万里
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机构:
内蒙古师范大学生物系,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick生物多样性保护研究中心,呼和浩特,VIC,Australia,VIC,Australia
马万里
;
Josquin Tibbits
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机构:
内蒙古师范大学生物系,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick生物多样性保护研究中心,呼和浩特,VIC,Australia,VIC,Australia
Josquin Tibbits
;
Mark Adams
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机构:
内蒙古师范大学生物系,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick生物多样性保护研究中心,呼和浩特,VIC,Australia,VIC,Australia
Mark Adams
.
土壤学报,
2004,
(01)
:103
-107
[3]
深海沉积物中微量DNA的提取及应用
[J].
论文数:
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机构:
赵晶
;
张锐
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厦门大学生命科学院
张锐
;
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机构:
林念炜
;
论文数:
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机构:
曾润颖
.
海洋与湖沼,
2003,
(03)
:313
-321
[4]
土壤微生物总DNA的提取和纯化
[J].
张瑞福
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机构:
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
张瑞福
;
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机构:
曹慧
;
崔中利
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南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
崔中利
;
李顺鹏
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南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
李顺鹏
;
樊奔
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南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
樊奔
.
微生物学报,
2003,
(02)
:276
-282
[5]
几种直接从高温热泉沉积物中提取DNA方法之比较
[J].
王涛
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教育部微生物资源开放重点实验室
王涛
;
柴丽红
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教育部微生物资源开放重点实验室
柴丽红
;
郭春雷
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教育部微生物资源开放重点实验室
郭春雷
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崔晓龙
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徐丽华
;
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彭谦
;
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姜成林
.
生物技术,
2003,
(01)
:17
-18
[6]
新鲜肿瘤标本活细胞与固定细胞的DNA含量分析比较
[J].
陶德定
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华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心湖北武汉,湖
陶德定
;
冷彦
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华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心湖北武汉,湖
冷彦
;
覃吉超
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华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心湖北武汉,湖
覃吉超
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余源
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华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心湖北武汉,湖
余源
;
龚建平
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华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心湖北武汉,湖
龚建平
.
癌症,
2001,
(05)
:502
-504
[7]
土壤微生物生物量作为红壤质量生物指标的探讨
[J].
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俞慎
;
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李勇
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王俊华
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车玉萍
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中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,
车玉萍
;
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机构:
潘映华
;
李振高
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中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,
李振高
.
土壤学报,
1999,
(03)
:413
-422
[8]
分子生物学方法在微生物生态学中的应用
[J].
夏北成
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机构:
中山大学环境科学研究所
夏北成
.
中山大学学报(自然科学版),
1998,
(02)
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-102
[9]
生物化学与分子生物学实验常用数据手册[M]. 科学出版社 , 吴冠芸等主编, 1999
[10]
DNA extraction from activated sludges
[J].
Bourrain, M
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机构:
Lab Cent Lyonnaise Eaux, Ctr Int Rech Eau & Environm, F-78230 Le Pecq, France
Bourrain, M
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Achouak, W
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Lab Cent Lyonnaise Eaux, Ctr Int Rech Eau & Environm, F-78230 Le Pecq, France
Achouak, W
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Urbain, V
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Lab Cent Lyonnaise Eaux, Ctr Int Rech Eau & Environm, F-78230 Le Pecq, France
Urbain, V
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Heulin, T
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机构:
Lab Cent Lyonnaise Eaux, Ctr Int Rech Eau & Environm, F-78230 Le Pecq, France
Lab Cent Lyonnaise Eaux, Ctr Int Rech Eau & Environm, F-78230 Le Pecq, France
Heulin, T
.
CURRENT MICROBIOLOGY,
1999,
38
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共 10 条
[1]
分子生物学方法在污染土壤微生物多样性研究中的应用
[J].
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机构:
李慧
;
陈冠雄
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中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室
陈冠雄
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张颖
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张成刚
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中国科学院沈阳应用生态研究所陆地生态过程重点实验室
张成刚
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土壤学报,
2004,
(04)
:612
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[2]
土壤微生物多样性研究的新方法
[J].
马万里
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机构:
内蒙古师范大学生物系,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick生物多样性保护研究中心,呼和浩特,VIC,Australia,VIC,Australia
马万里
;
Josquin Tibbits
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内蒙古师范大学生物系,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick生物多样性保护研究中心,呼和浩特,VIC,Australia,VIC,Australia
Josquin Tibbits
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Mark Adams
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内蒙古师范大学生物系,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick,ForestScienceCenter,UniversityofMelboume,Creswick生物多样性保护研究中心,呼和浩特,VIC,Australia,VIC,Australia
Mark Adams
.
土壤学报,
2004,
(01)
:103
-107
[3]
深海沉积物中微量DNA的提取及应用
[J].
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赵晶
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张锐
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厦门大学生命科学院
张锐
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林念炜
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曾润颖
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海洋与湖沼,
2003,
(03)
:313
-321
[4]
土壤微生物总DNA的提取和纯化
[J].
张瑞福
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机构:
南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
张瑞福
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崔中利
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崔中利
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李顺鹏
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李顺鹏
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樊奔
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南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
樊奔
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微生物学报,
2003,
(02)
:276
-282
[5]
几种直接从高温热泉沉积物中提取DNA方法之比较
[J].
王涛
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王涛
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柴丽红
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柴丽红
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郭春雷
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郭春雷
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徐丽华
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彭谦
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姜成林
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生物技术,
2003,
(01)
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新鲜肿瘤标本活细胞与固定细胞的DNA含量分析比较
[J].
陶德定
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华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心湖北武汉,湖
陶德定
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冷彦
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余源
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余源
;
龚建平
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华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心,华中科技大学同济医学院附属同济医院分子医学中心湖北武汉,湖
龚建平
.
癌症,
2001,
(05)
:502
-504
[7]
土壤微生物生物量作为红壤质量生物指标的探讨
[J].
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俞慎
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中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,,中国科学院南京土壤研究所!南京,
车玉萍
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李振高
.
土壤学报,
1999,
(03)
:413
-422
[8]
分子生物学方法在微生物生态学中的应用
[J].
夏北成
论文数:
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机构:
中山大学环境科学研究所
夏北成
.
中山大学学报(自然科学版),
1998,
(02)
:98
-102
[9]
生物化学与分子生物学实验常用数据手册[M]. 科学出版社 , 吴冠芸等主编, 1999
[10]
DNA extraction from activated sludges
[J].
Bourrain, M
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机构:
Lab Cent Lyonnaise Eaux, Ctr Int Rech Eau & Environm, F-78230 Le Pecq, France
Bourrain, M
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Achouak, W
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Lab Cent Lyonnaise Eaux, Ctr Int Rech Eau & Environm, F-78230 Le Pecq, France
Heulin, T
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CURRENT MICROBIOLOGY,
1999,
38
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