深海沉积物中微量DNA的提取及应用

被引:9
作者
赵晶
张锐
林念炜
曾润颖
机构
[1] 厦门大学生命科学院
[2] 国家海洋局海洋生物工程重点实验室
[3] 国家海洋局海洋生物工程重点实验室 厦门
[4] 厦门
关键词
深海沉积物; 总DNA提取; 腐殖酸;
D O I
暂无
中图分类号
Q178.53 [海洋生物];
学科分类号
070703 ;
摘要
采用化学裂解和酶解相结合的方法 ,进行了深海沉积物中微量DNA的提取 ,并采用DNA吸附树脂进行纯化。结果表明 ,该方法能有效地去除沉积物中的腐殖酸等抑制剂 ,每克湿重沉积物样品可得到DNA约 1 6 μg,回收率可达 95 % ,所得到的DNA分子片段均在 2 3kb左右 ,纯化后的DNA可直接应用于各种分子生物学操作。利用细菌 1 6SrDNA通用引物对所提取的深海沉积物DNA进行了PCR RFLP及系统发育分析 ,各主要细菌类群均能检出 ,证实该方法可以应用于深海等极端环境中微生物的多样性调查、系统发育分析以及特殊功能基因的筛选 ,同时还可应用于环境样品中生物量的半定量估计
引用
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