用SAM法分离谷子SSR位点的研究

被引：6

作者：

贾小平 ^{[1
]}

王天宇 ^{[2
]}

黎裕 ^{[2
]}

宋燕春 ^{[2
]}

石云素 ^{[2
]}

机构：

[1] 河南科技大学农学院

[2] 中国农业科学院作物科学研究所

来源：

河南农业科学 | 2009年 / 08期

关键词：

谷子; 选择扩增微卫星法; SSR;

D O I：

10.15933/j.cnki.1004-3268.2009.08.015

中图分类号：

S515 [粟（谷子、小米）];

学科分类号：

摘要：

首次将SAM(选择扩增微卫星)法用于谷子SSR位点的分离,共获得163个含有SSR序列的克隆,其中unique SSR 106个,占所有SSR序列的65%,60个SSR序列的3′端成功设计特异引物,占unique SSR的56%。这60个SSR序列中,55个为完整型重复;5个为复合型重复,由2种不同的重复单元组成,没有发现不完整重复类型。同时讨论了SAM法在应用过程中应注意的一些关键技术环节,如接头连接、核苷酸选择策略、特异引物设计原则,及该方法存在的一些不足,如获得SSR重复次数少、一端侧翼序列缺失对扩增多态性的消极影响等。

引用

页码：17 / 21

页数：5

共 8 条

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