基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在幽门螺杆菌鉴定中的应用题录附视频

被引:6
作者
陈飞
杨峰
张景皓
方毅
王诗雯
张艳梅
赵虎
机构
[1] 上海,复旦大学附属华东医院检验科
关键词
幽门螺杆菌; 光谱法, 质量, 基质辅助激光解吸电离;
D O I
暂无
中图分类号
R446.5 [微生物学检验];
学科分类号
摘要
目的优化幽门螺杆菌(H.pylori)基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测前处理方法, 建立MALDI-TOF MS的H.pylori超级图谱并验证其鉴定能力。方法收集2015年1月至2016年7月期间复旦大学附属华东医院临床胃活检组织样本469例, 进行H.pylori分离培养和鉴定, 并利用16 S rRNA测序验证, 共获得91株H.pylori菌株用于后续MALDI-TOF MS检测。在进行MALDI-TOF MS检测前, 比较50%异丙醇、甲酸乙腈(1∶1)以及70%甲酸用于H.pylori前处理的效果。从91株临床分离的H.pylori菌株中随机选取40株进行MALDI-TOF MS检测, 再进一步分别随机抽取原始图谱分为5株组、10株组、20株组和30株组, 每组重复3次, 采用SARAMIS Premium软件分析, 建立超级图谱。剩余的51株H.pylori菌株用于验证新建超级图谱的鉴定能力。结果 70%甲酸进行前处理效果最好。30株组建立的超级图谱的鉴定率最高, 可达90.2%。用于验证的306张质谱图中46.1%的图谱取得了高可信度(≥90%)的鉴定结果、22.2%的图谱取得了中低度可信的鉴定结果, 31.7%的图谱无鉴定结果。结论本研究优化了MALDI-TOF MS鉴定H.pylori的前处理方法, 并建立了H.pylori超级图谱, 提高了MALDI-TOF MS对于H.pylori的鉴定能力, 为临床上快速准确地鉴定H.pylori提供了新的检测平台。(中华检验医学杂志, 2017, 40:31-35)
引用
收藏
页码:31 / 35
页数:5
相关论文
共 12 条
[11]  
Helicobacter pylori infection; host genetics and gastric cancer.[J] Shanks Anne-Marie;El-Omar Emad M Journal of digestive diseases 2009,
[12]  
Helicobacter pylori and gastrointestinal tract adenocarcinomas.[J] Peek Richard M;Blaser Martin J Nature reviews. Cancer 2002,