系统发育分析指示细菌向Apicoplast的水平基因转移(英文)

被引：2

作者：

朱新宇

机构：

[1] 南通师范学院生命科学与技术系南通

来源：

遗传学报 | 2004年 / 11期

关键词：

Apicoplast; clpC基因; 质体; 混合基因组; 水平基因转移;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q933 [微生物遗传学];

学科分类号：

071007 ;

摘要：

顶复合器门的原生动物 (Apicomplexanprotozoa)含有一个高度退化的质体样 (plastid like)细胞器 ,定名为apicoplast。来自apicoplast的clpC基因和它在其他质体和细菌中的同源物用来重建apicoplast的系统发育史。使用邻接法 (Neighbor Joining)、最小进化法 (MinimumEvolution)、最大简约法 (MaximumParsimony)和最大似然法(MaximumLikelihood)建立进化树。此外为了避免由于序列之间相似的碱基组成而引起的虚假聚类 ,建立了基于LogDet距离的核苷酸NJ树 ;以及为了避免由于在核苷酸和氨基酸水平上的突变饱和而引起的长分枝吸引 (LongBranchAttraction ,LBA) ,建立了基于非饱和位点的核苷酸和氨基酸序列的系统发育树。重建结果强有力地支持apicoplast和细菌B .buigdorferi之间的单系 (monophyly)起源关系 ,也强化了apicoplasst属于混合基因组的假设 ,并且提供了对这个混合基因组起源的新的认识

引用

页码：1316 / 1320

页数：5

共 3 条

[1] 单细胞生物进化研究的进步 [J].

胡楷 ;

吴庆书 .

遗传, 2002, (01) :104-110

[2]

Phylogeny of Ultra-Rapidly Evolving Dinoflagellate Chloroplast Genes: A Possible Common Origin for Sporozoan and Dinoflagellate Plastids[J] . Zhaoduo Zhang,Beverley R. Green,Thomas Cavalier-Smith.Journal of Molecular Evolution . 2000 (1)

[3]

Nuclearencoded, plastid-targeted genes suggest a single common origin for apicomplexan and dinoflagellate plastids. Fast N M, Kissinger J C, Roos D S, Keeling P J. Molecular Biology and Evolution . 2001

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