正交法用于真菌微卫星PCR体系优化

被引:7
作者
杨艳秋 [1 ]
贺丹 [1 ]
王爽 [1 ]
郭亮 [1 ]
张宇 [1 ]
横山耕治 [2 ]
王丽 [1 ]
机构
[1] 吉林大学基础医学院病原生物学教研室
[2] 日本国立千叶大学真菌医学研究中心
关键词
真菌; 微卫星重复; 聚合酶链反应; 正交法;
D O I
10.13481/j.1671-587x.2006.06.069
中图分类号
Q93-33 [微生物学技术与微生物学实验];
学科分类号
071005 ; 100705 ;
摘要
目的:探讨影响真菌微卫星聚合酶链反应(SSR-PCR)的多个因素,建立PCR的最佳反应体系,为进一步进行真菌的鉴定、遗传多样性研究奠定基础。方法:利用正交设计,从Taq DNA聚合酶、模板DNA、dNTP、引物4种因素,对真菌微卫星反应体系进行优化分析,并确定PCR适宜的退火温度及循环次数。结果:各因素的不同水平对PCR结果都有显著影响,其中模板DNA影响最大。在PCR反应体系中(25μL),Taq DNA聚合酶1U,模板DNA 30 ng,dNTP 150μmol.L-1,引物0.25μmol.L-1为最佳。结论:采用正交法实验设计,对真菌微卫星PCR体系优化更科学,得出的实验体系有效范围宽,且高效、快捷。
引用
收藏
页码:1108 / 1111
页数:4
相关论文
共 6 条
[1]   正交实验法在PCR反应条件优化中的应用 [J].
杨水云 ;
李续娥 ;
吴明宇 ;
孙飞龙 ;
李剑君 .
生物数学学报, 2005, (02) :202-206
[2]   山羊RAPD反应条件的研究 [J].
陈祥 ;
张勇 ;
李国红 ;
廖正录 ;
简承松 ;
魏泓 .
贵州农业科学, 2004, (04) :11-13
[3]   红松ISSR-PCR实验系统影响因素 [J].
冯富娟 ;
王凤友 ;
刘彤 .
植物学通报, 2004, (03) :326-331
[4]   正交设计优化不结球白菜ISSR反应体系研究 [J].
王彦华 ;
侯喜林 ;
徐明宇 ;
不详 .
西北植物学报 , 2004, (05) :899-902
[5]   苹果基因组RAPD反应体系影响因子的优化 [J].
田义轲 ;
王彩虹 ;
张继澍 ;
戴洪义 ;
顾耘 ;
段方猛 .
莱阳农学院学报, 2003, (03) :157-161
[6]  
计算化学.[M].郭纯孝编著;.化学工业出版社.2004,