甘蔗花叶病毒3’末端基因的克隆及外壳蛋白序列分析比较

被引：15

作者：

李利君

周仲驹

谢联辉

机构：

[1] 福建农林大学植物病毒研究所!福建福州,福建农林大学植物病毒研究所!福建福州,福建农林大学植物病毒研究所!福建福州

来源：

中国病毒学 | 2001年 / 01期

关键词：

甘蔗花叶病毒; 3’端非编码区; 外壳蛋白; 序列分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

S432.41 [];

学科分类号：

090401 ;

摘要：

选取我国SCMV优势株系A株系的分离物SCMV CA为材料 ,经过病毒和病毒RNA的提纯 ,反转录获得病毒cDNA ,并克隆到载体 pUC19的SmaI位点上 ,筛选得到多个重组质粒。选取其中一个克隆SCMV CA5 4进行测序 ,得到一个全长为 12 96bp的核苷酸序列。这段序列由一个长为 10 44bp的开放阅读框架 (ORF)和一个长 2 79bp的 3’末端非编码区序列 ( 3’ UTR)及 poly(A)尾巴组成。这个ORF包括病毒完整的外壳蛋白 (CP)及部分核内含体蛋白b(NIb)基因序列。将所得序列同已知SCMV亚组中各株系分离物的核苷酸和氨基酸进行同源性比较 ,结果表明该序列与其它株系分离物CP核苷酸序列的同源性介于 6 3.7%～ 77.6 %之间 ,氨基酸的同源性介于 6 4%～ 89%之间。根据马铃薯Y病毒属的序列同源性划分标准 ,SCMV CA与其它株系或分离物的同源性关系均介于种与株系划分标准之间。这是我国首次报道SCMVCP基因序列

引用

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共 4 条

[1] 甘蔗花叶病毒的提纯及抗血清制备 [J].