从胚胎上皮细胞基因表达谱变化分析肺与大肠相表里内涵

目的:比较胚胎发育3个时期肺与结肠上皮细胞基因表达水平的相似性,为肺、肠同源发生提供依据,丰富"肺与大肠相表里内涵"。方法:应用c DNA微阵列技术对胚胎肺组织与结肠组织基因表达情况进行检测和比较,分离2种组织上皮细胞,抽提细胞总RNA、扩增、Cy3染色后,与牛全基因组芯片杂交,荧光信号扫描,以Agilent feature extraction软件分析,筛选同源表达基因,进一步对同源表达基因进行GO分析和pathway分析;以qRT-PCR验证芯片结果。结果:在胚胎肺、结肠不同时期,两者上皮细胞基因表达均有不同程度的相似性;GO分析表明在两种胚胎上皮细胞发育过程中,3个时期上皮细胞生物过程的表达基因符合率分别为15%、27%、53%,其中比例较高的有生物调节、细胞分化、细胞周期等;3个时期上皮细胞分子功能表达基因符合率分别为19%、27%、24%,其中比例较高的包括转移酶活性、激酶活性和酶调节活性;3个时期上皮细胞组分表达基因符合率分别为66%、46%,23%,比例较高的为非膜结合细胞器、胞外区、大分子复合物组分等;pathway分析显示m TOR信号通路、PI3K/Akt、wnt通路有明显相似性,共涉及14个相似基因表达。结论:胚胎发育3个时期,肺与肠基因表达均存在不同程度的相似性,早期二者相似基因表达主要体现在上皮细胞形态发育上;中晚期则主要在于二者功能上。