对虾Taura综合症病毒Taqman实时定量RT-PCR检测方法的建立与应用

被引:4
作者
岳志芹 [1 ]
刘荭 [2 ]
梁成珠 [1 ]
高宏伟 [1 ]
雷质文 [1 ]
徐彪 [1 ]
朱来华 [1 ]
江育林 [2 ]
机构
[1] 山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心
[2] 深圳出入境检验检疫局水生动物疫病国家重点实验室
关键词
TSV; 实时定量RT-PCR; Taqman探针;
D O I
暂无
中图分类号
S945.1 [虾类];
学科分类号
摘要
建立了Taqman实时定量RT-PCR方法检测对虾的Taura综合症病毒(Taura syndrome virus,TSV)。选取TSV基因组的保守序列,利用Primer Express 2.0软件设计引物和探针,扩增产物长度为73bp。以含有TSV目的扩增片段的质粒为标准品,进行实时定量RT-PCR反应,结果表明质粒DNA在6~6×106个拷贝,共7个数量级的范围内有"S"型扩增曲线。根据病毒拷贝数与Ct值制备了标准曲线,可以用于病毒的定量分析。该方法的检测灵敏度为6个病毒粒子。该方法的重现性好,组内的实验变异系数为0.04%~2.70%,组间实验变异系数为0.92%~4.67%。引物和探针对于对虾基因组RNA、黄头病毒RNA都没有扩增反应,表现出良好的特异性。实时定量RT-PCR检测TSV方法的建立,对于虾病的临床诊断及流行病学研究具有重要意义。
引用
收藏
页码:141 / 144
页数:4
相关论文
共 6 条
[1]   RT-PCR法检测我国东南沿海凡纳滨对虾的桃拉综合征病毒 [J].
黄新新 ;
莫胜兰 ;
陆承平 .
中国病毒学, 2005, (05) :90-92
[2]   多重RT-PCR同时检测鉴别三种对虾病毒的研究与应用 [J].
谢芝勋 ;
庞耀珊 ;
邓显文 ;
唐小飞 ;
刘加波 .
病毒学报, 2005, (05) :393-396
[3]   Quantitative assay for measuring the Taura syndrome virus and yellow head virus load in shrimp by real-time RT-PCR using SYBR Green chemistry [J].
Dhar, AK ;
Roux, MM ;
Klimpel, KR .
JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS, 2002, 104 (01) :69-82
[4]   Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2-ΔΔCT method [J].
Livak, KJ ;
Schmittgen, TD .
METHODS, 2001, 25 (04) :402-408
[5]  
Shrimp diseases and current diagnostic methods[J] . D.V Lightner,R.M Redman.Aquaculture . 1998 (1)
[6]  
Taura syndromeof penaeid shrimp:cloning of viral genome fragments and devel-opment of specific gene probes. Poulos B T,Lightner Mari J,Bonami J R,et al. Diseases of Aquatic Organisms . 1998