基于PCR-DGGE指纹的南海海绵共附生细菌优势种群的揭示与系统发育分析

被引:7
作者
何丽明
李志勇
吴杰
胡叶
蒋群
机构
[1] 上海交通大学生命科学技术学院海洋生物技术实验室
关键词
海绵共附生细菌; 16SrDNA; PCR-DGGE指纹; 系统发育分析;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2006.03.032
中图分类号
Q958.122.3 []; Q938 [微生物生态学和地区分布];
学科分类号
摘要
采用PCR-DGGE指纹、克隆测序和系统发育分析技术较系统地对我国南海贪婪倔海绵(Dysidea avara)和澳大利亚厚皮海绵(Craniella australiensis)共附生的优势细菌进行了研究。研究发现变形菌门(Proteobacteria)细菌是这两种海绵中的主要优势细菌,贪婪倔海绵中的变形菌包含了α、β、γ三种类型,而澳大利亚厚皮海绵中仅有γ一种类型。两种海绵都有拟杆菌(Bacteroidetes),但是具体的种类不同。这些细菌都是第一次在海绵中被发现。澳大利亚厚皮海绵共附生的优势细菌还包括放线菌属(Actinobacterium)及厚壁菌门(Firmicutes)细菌,菌群多样性要比贪婪倔海绵的丰富。两种海绵尽管来自于同一海域但其共附生优势细菌的组成明显不同,这说明海绵共附生微生物具有宿主特异性。
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