2010年上海地区肠道病毒71型分离株VP1区基因特征分析

被引：7

作者：

朱雯

居丽雯

蒋露芳

熊海燕

汪千力

姜庆五

机构：

[1] 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室

来源：

中华传染病杂志 | 2011年 / 10期

关键词：

手足口病; 肠道病毒71型,人; 基因型; 序列同源性,核酸; 序列分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

R72 [儿科学]; R4 [临床医学];

学科分类号：

100202 [儿科学]; 100218 [急诊医学];

摘要：

目的了解2010年上海地区手足口病患者中肠道病毒71型(EV71)分离株VP1区基因特征。方法选取2010年不同时间的轻症与重症病例EV71分离株18株,对其抗原决定簇部位VP1区进行核苷酸序列测定、比对,并与美国国立生物技术信息中心公布的EV71 A、B、C各基因型分离株序列进行比对,构建系统发生树。结果上海地区18株病毒分离株与A、B基因型参考毒株的核苷酸同源性分别为81.5%～82.6%、83.4%～84.2%,氨基酸同源性分别为94.3%～95.0%、96.6%～97.0%,与C基因型比较,核苷酸与氨基酸同源性分别为87.4%～99.2%与98.7%～100.0%。而与2008年安徽省阜阳市的EV71流行株(C4亚型)的核苷酸同源性可达97.8%～99.2%,氨基酸同源性99.3%～100.0%。在系统发生树上,这18株毒株均在C基因型中,与C4亚型属同一分支。重症病例与轻症病例EV71分离株在VP1基因区并无明显差异。结论上海地区手足口病患者中分离的EV71流行株应属C基因型的C4亚型。

引用