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甘蔗ACC氧化酶基因片段的克隆与序列分析
被引:13
作者:
王自章
李杨瑞
张树珍
林俊芳
郭丽琼
机构:
[1] 广西大学农学院,广西农业科学院,中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室,中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室,中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室南宁,清华大学生物系,北京,南宁,海口,海口,海口
来源:
关键词:
1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶;
基因克隆;
甘蔗;
D O I:
暂无
中图分类号:
Q943 [植物细胞遗传学];
学科分类号:
071007 ;
090102 ;
摘要:
1 -氨基环丙烷 - 1-羧酸 (ACC)氧化酶是植物乙烯合成的一个关键酶 ,乙烯作为一种内源激素 ,对植物生长、老熟过程有多方面的调节作用。根据报道的各种植物ACC氧化酶氨基酸序列上前后两个保守区设计两个简并引物 ,以甘蔗总DNA为模板 ,通过PCR扩增到一个 940bp的基因片段。将片段序列在NCBI的BLAST软件上进行同源性搜寻 ,显示的 63个序列全部是ACC氧化酶基因 ,因而认为克隆到的片段就是甘蔗ACC氧化酶基因的一个成员。经对不同植物来源的ACC氧化酶基因家族进行比较分析 ,去除一个 10 3bp的“内含子”后 ,推导的氨基酸序列为 2 79个残基 ,占推测全长氨基酸残基总数的 86%左右。经同源性分析 ,序列与毛竹和水稻ACC氧化酶的同源率达到 86%。系统进化分析表明 ,该序列最先与水稻、其次和香蕉的ACC氧化酶聚类 ,然后再与双子叶植物的ACC氧化酶聚类 ,符合按形态特征分类的血缘关系。基因的获得对下一步了解乙烯的合成表达与甘蔗生长、成熟过程之间的关系奠定了基础
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