阳虚质者基因组拷贝数变异小样本研究

被引:21
作者
姚实林 [1 ]
张祖志 [2 ]
吴君霞 [3 ]
程楠 [3 ]
许霞 [4 ]
解光艳 [1 ]
曹健 [1 ]
机构
[1] 安徽中医药大学科技处
[2] 安徽中医药大学中西医结合临床学院
[3] 安徽中医药大学神经病学研究所
[4] 安徽中医药大学中医临床学院
关键词
阳虚质; 遗传机制; 拷贝数变异;
D O I
暂无
中图分类号
R229 [其他];
学科分类号
100501 [中医基础理论];
摘要
目的通过检测全基因组拷贝数变异(CNV)探究阳虚质的遗传机制。方法按照《中医体质分类与判定》标准纳入阳虚质与平和质受试者各30例,提取外周血白细胞DNA,采用SNP6.0基因分型芯片进行全基因组关联分析,采用PennyCNV软件分析单个样本CNVs,逐个常染色体鉴定阳虚质特异的拷贝数变异区域(CNVR),通过人类基因组浏览器检索CNVR的相关基因及其注释。结果平和质组平均CNV数为12.63±3.39,最小值为8,最大值为20;去掉2个异常值后,阳虚质组平均CNV数为15.04±8.95,最小值为2,最大值为38。从28个阳虚质样本中共鉴定出26个CNVR,其中有19个增加型CNVR、6个删除型CNVR、1个混合型CNVR。大多数CNVR仅被少数阳虚质受试者共享,仅7个CNVR被不少于5个阳虚质受试者共享。阳虚质特异的CNVR所包含的代表基因功能涉及细胞内外信号转导、代谢调节、免疫反应等。结论阳虚质者基因组存在一些特异的CNVs,这些CNVs可能通过影响细胞内外信号转导、物质代谢(能量代谢)、免疫反应等相关基因的表达而导致阳虚质"表型"。
引用
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共 5 条
[1]
Observations on Copy Number Variations in a Kidney-yang Deficiency Syndrome Family.[J].Wei Wei Liu;Yong Xiang Gao;Li Ping Zhou;Azure Duan;Ling Ling Tan;Wan Zhen Li;Min Yan;Hong Ya Yang;Shi Lin Yan;Mi Qu Wang;Wei Jun Ding.Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine.2011,
[2]
中医体质学.[M].王琦 主编.中国医药科技出版社.1995,
[3]
基于974例调查数据的中医兼夹体质分析 [J].
姚实林 ;
张祖志 ;
杨新胜 ;
许霞 ;
曹健 ;
解光艳 ;
张倩 .
中西医结合学报, 2012, 10 (05) :508-515
[4]
8448例一般人群的中医体质类型与健康状况关系的分层分析 [J].
朱燕波 ;
王琦 ;
陈柯帆 ;
吴玉娥 ;
洪伟丽 ;
刘利 .
中西医结合学报, 2011, 9 (04) :382-389
[5]
阳虚质成因论析 [J].
姚实林 ;
王琦 .
中国中医基础医学杂志 , 2008, (06) :405-407