油茶SSR-PCR反应体系的优化研究

被引:23
作者
范小宁 [1 ]
林萍 [2 ]
张盛周 [1 ]
机构
[1] 安徽师范大学生命科学学院生物环境与生态安全省级重点实验室
[2] 中国林科院亚热带林业研究所
关键词
油茶; SSR-PCR; 正交设计; 体系优化;
D O I
10.13989/j.cnki.0517-6611.2011.23.214
中图分类号
S794.4 [油茶];
学科分类号
090702 [森林培育];
摘要
[目的]优化油茶(Camellia oleifera)SSR-PCR反应体系。[方法]应用改良CTAB法提取油茶基因组DNA,采用L16(45)正交设计试验,对影响油茶SSR-PCR反应体系的5个因素(Taq聚合酶浓度、模板浓度、dNTPs浓度、引物浓度和Mg2+浓度)在4水平上进行筛选。PCR结果经统计分析软件DPS分析,并对退火温度进行了摸索,确立了油茶SSR-PCR的优化体系。[结果]油茶SSR-PCR的优化体系总体积为20μl,包括Taq聚合酶量为1.0 U/20μl,模板浓度75 ng/20μl,dNTPs浓度为0.15 mmol/L,引物浓度为0.40μmol/L,Mg2+浓度为1.50 mmol/L,退火温度为50℃。[结论]该研究确定的优化体系可以为油茶资源遗传多样性分析奠定技术基础。
引用
收藏
页码:14098 / 14102
页数:5
相关论文
共 17 条
[1]
杏SSR反应体系的优化研究 [J].
宁宁 ;
王玉柱 ;
张俊怀 ;
杨丽 ;
孙浩元 ;
章镇 .
北方园艺, 2009, (03) :12-15
[2]
油茶高产无性系的ISSR分子鉴别 [J].
温强 ;
雷小林 ;
叶金山 ;
江梅 ;
左继林 ;
黄丽莉 ;
江香梅 ;
徐林初 .
中南林业科技大学学报, 2008, (01) :39-43
[3]
油茶DNA提取及RAPD分析最佳反应体系的建立 [J].
阙生全 ;
张芳 .
安徽农业科学, 2008, (03) :902-903+905
[4]
黄瓜SRAP反应体系的正交设计优化 [J].
王振国 ;
张海英 ;
于广建 ;
张峰 ;
王永健 ;
许勇 ;
郭绍贵 ;
宫国义 .
华北农学报, 2007, (04) :112-115
[5]
樱桃主栽品种的遗传多样性分析 [J].
艾呈祥 ;
辛力 ;
余贤美 ;
张力思 ;
魏海蓉 ;
苑克俊 ;
孙清荣 ;
刘庆忠 .
园艺学报, 2007, (04) :871-876
[6]
油茶优良无性系ISSR分子鉴别 [J].
张国武 ;
钟文斌 ;
乌云塔娜 ;
谭晓风 ;
杜天真 .
林业科学研究, 2007, (02) :278-282
[7]
香蕉SSR反应体系的优化 [J].
郑丽珊 ;
王静毅 ;
冀小蕊 ;
武耀廷 .
热带农业科学, 2007, (02) :14-17
[8]
核桃SSR反应体系的优化 [J].
刘晓丽 ;
何天明 ;
张美勇 ;
张立杰 ;
慈志娟 ;
张春雨 ;
陈学森 .
果树学报, 2007, (02) :140-145
[9]
用EST-SSR标记对茶树种质资源的研究 [J].
金基强 ;
崔海瑞 ;
龚晓春 ;
陈文岳 ;
忻雅 .
遗传, 2007, (01) :103-108
[10]
油茶种质资源遗传多样性分析 [J].
黄永芳 ;
陈锡沐 ;
庄雪影 ;
雷治国 ;
陈永忠 ;
彭邵峰 .
林业科学, 2006, (04) :38-43