苹果栽培品种SSR指纹图谱的构建

【目的】通过构建苹果栽培品种的SSR标记指纹图谱数据库,以实现对苹果品种的快速、准确鉴定。【方法】以国内外40个主要栽培品种为试验材料,选用均匀分布于17条染色体上的144对SSR引物进行PCR扩增并采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳与SSR荧光标记毛细管电泳相结合的方法进行检测。【结果】结果表明,从144对SSR引物中筛选出了35对多态性较高、谱带清晰的引物,35对引物共检测到314个等位基因,每对SSR引物扩增出等位基因数3～15个,平均8.97个;多态性信息含量指数(PIC)变化为0.455 3～0.834 6,平均为0.692 0;各个位点的杂合度在0.475 0～1.000 0,平均为0.794 3;标记系数(MI)平均为6.208 0,其中CH04c10引物对苹果基因组DNA变异检测最有效,其多态性信息含量指数和标记指数均最高,分别为0.834 6和12.519 0。以CH03d07、NZ02b1和CH05c04这3对引物进行组合鉴定,即可将40个苹果品种完全区分开。与6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测能更准确读出目标片段的大小,检测效果更为理想,更适合于DNA指纹图谱数据库的建立。【结论】将2种检测方法结合构建苹果品种DNA指纹图谱,结果更准确、更可靠。