广东番茄曲叶病毒G3分离物基因组DNA-A的分子特征

被引:22
作者
何自福
虞皓
罗方芳
机构
[1] 广东省农业科学院植物保护研究所
[2] 广东省农业科学院植物保护研究所 广东省植物保护新技术重点实验室
[3] 广州
[4] 广东省植物保护新技术重点实验室
基金
广东省自然科学基金;
关键词
广东番茄曲叶病毒G3; DNA-A; 序列分析; 分子特征;
D O I
10.13926/j.cnki.apps.2005.03.004
中图分类号
S436.412 [番茄病虫害];
学科分类号
090401 ; 090402 ;
摘要
从采集于广东花都的番茄曲叶病病株上分离到病毒分离物ToLCGDV-[G3],序列分析结果表明,其DNA-A为单链环状,全长2744nt,共有6个ORFs,其中病毒链上编码AV1(CP)、AV2,互补链上编码AC1、AC2、AC3和AC4。BLAST结果显示,与ToLCGDV-[G3]基因组有同源关系的均属双生病毒科菜豆金色花叶病毒属。进一步比较结果表明,ToLCGDV-[G3]与有同源性的菜豆金色花叶病毒属病毒的DNA-A全序列同源率最高为87·9%。其中IR的同源率为59·0%85·3%,而AV1、AV2、AC1、AC2、AC3和AC4这6个ORFs同源率分别为73·6%95·2%、64·0%95·4%、71·7%87·7%、69·6%93·9%、67·7%95·1%和64·1%94·2%,它们各自编码的氨基酸序列同源率分别为76·3%99·2%、52·6%95·7%、69·7%88·1%、51·9%88·9%、63·4%92·5%和33·0%90·7%。系统进化关系分析结果显示,ToLCGDV-[G3]与ToLCGDV-[G2]亲缘关系最近,二者组成一个独立的分支,与其它40种菜豆金色花叶病毒属病毒的亲缘关系均较远。因此,ToLCGDV-[G3]可能是一个先前未报道的双生病毒科菜豆金色花叶病毒属新种。
引用
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