北京地区Noro病毒主要衣壳蛋白编码基因的序列分析

目的确定从北京地区婴幼儿腹泻标本中检测到的3株Noro病毒的基因型别及主要衣壳蛋白(VP1)编码基因的特点。方法从经酶免疫分析法筛选到的Noro病毒阳性的粪便标本中应用RT-PCR方法扩增Noro病毒VP1全基因,克隆到pBS-T载体中并测定核苷酸序列,与GenBank中的其他Noro病毒VP1基因序列进行比较和分析。结果经过扩增和测序,标本CR2905、CR2932和CR2987的VP1基因全长分别为1620 bp、1623 bp和1647 bp,编码不同大小的蛋白。CR2905和CR2932与GⅡ-4型的氨基酸同源性在80%以上,属于Noro病毒GⅡ基因组(Genogroup)的GⅡ4型(Geno- type);CR2987与GⅡ-3型的氨基酸同源性在80%以上,属于Noro病毒GⅡ基因组的GⅡ-3型。CR2905、CR2932与其他GⅡ-4型的变异性在9.1%至12.5%之间,提示为新的变异株。结论北京地区婴幼儿中存在不同基因型别的Noro病毒的感染,根据基因的同源性分析,CR2905、CR2932可能为GⅡ-4型的新的变异株。