采用傅里叶变换红外光谱、二阶导数光谱、共有峰率和变异峰率的双指标序列等方法,首次对祖师麻中3种已知含量及功效的标准物质、不同提取方法提取的有效部位及渗漉液的不同萃取部位进行了结构特征的分析和鉴别。结果表明,祖师麻甲素及7-OH香豆素在1700cm-1附近内酯及芳环在1600cm-1附近有强吸收,紫丁香苷芳环vC=c1589、1509cm-1骨架振动及羟基vO-H3563cm-1的吸收峰较强。加热回流提取的有效部位在3300cm-1处有较强的羟基VO-H伸缩振动或氨基酸等vN-H伸缩振动的叠加,渗漉法提取的有效部位在此处也有较强吸收峰,且3518cm-1处的VN-H较为明显。另外,两法提取的有效部位红外图谱共有峰率仅为45%,且变异峰率高达83.8%。其不同萃取部位的红外一维图谱均较好的体现了C=O、C—H、O—H、N—H及甲基、亚甲基的伸缩振动;对比各萃取部位的二阶导数谱,发现石油醚部除745—715cm-1附近外,其余位置峰数明显少于其他3个萃取部位,乙酸乙酯部的峰数较多且峰形较好,氯仿和正丁醇部峰数与之相差不多,但峰形较弱,通过双指标法得出氯仿部和石油醚部所含物质种类相差极大,而氯仿部和乙酸乙酯部较为相近。