应用PCR-DGGE指纹技术分析高温季节仿刺参养殖水环境中菌群多样性

被引:25
作者
关晓燕
周遵春
陈仲
姜北
汪笑宇
董颖
杨爱馥
邓欢
徐晓红
机构
[1] 辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋环境监测总站辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室
关键词
仿刺参; 细菌; 16S rDNA; DGGE指纹;
D O I
暂无
中图分类号
S968.9 [其他海产动物养殖];
学科分类号
090807 [水产动物营养与饲料学];
摘要
采用16S rDNA的PCR-DGGE基因指纹技术,于6~9月间,对辽宁普兰店湾2个相邻的刺参养殖池塘进行了养殖水环境中菌群多样性的分析,首先用2216E固体培养基对仿刺参养殖水环境中的细菌总数进行统计,再采用PCR-DGGE指纹技术分析菌群多样性。结果表明,池塘水环境中较高水平的细菌数,且9月为6月的3倍;高温季节刺参养殖水环境中细菌种群较为丰富,其中大多数属于变形菌门;6~9月份样品具有一致的优势菌群,分别为Pseudomonas sp.,Uncul-tureddelta bacterium,Ostreococcus sp.以及Unculturedalpha proteobacterium。同时发现,同一时间采集的样品,有一定的菌群相似性,并在聚类分析图中分别成簇,检测样品的细菌多样性指数在1.7至2.5之间。
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