大白菜的适宜AFLP-Pst Ⅰ/Mse Ⅰ引物组合

被引：5

作者：

许磊 ^{[1
]}

李宏博 ^{[1
]}

林荣杓 ^{[2
]}

朴钟云 ^{[1
]}

机构：

[1] 沈阳农业大学园艺学院

[2] 忠南大学农业生命科学学院园艺系

来源：

华北农学报 | 2009年 / 04期

基金：

教育部留学回国人员科研启动基金;

关键词：

大白菜; AFLP; 引物组合; GC含量;

D O I：

暂无

中图分类号：

S634.1 [大白菜];

学科分类号：

090202 ;

摘要：

基于PCR的DNA指纹鉴定技术AFLP广泛应用于生物多样性、遗传图谱构建、基因定位、分子系统发育和品种鉴定等方面。为了筛选出大白菜适宜的AFLP引物组合,研究以抗根肿病大白菜双单倍体CR Shinki、感病自交系94SK及其后代F2构成的纯合抗病和纯合感病DNA混合池为材料,利用256对Pst Ⅰ/Mse Ⅰ引物组合进行了AFLP分析。结果表明:平均每个组合检测到55条带,共扩增13079条带,平均每1000条带检测到1.30个根肿病抗性基因连锁标记;多态性带数为3167条,双亲间多态性频率约为0.24;扩增带数与多态性带数呈线性正相关,引物组合中的不同GC含量与扩增带数和多态性带数存在显著性差异,并表现出线性负相关。筛选出的适宜53对引物组合共扩增出4381条带,占总扩增片断的33.50%,平均每对扩增出83条,其中9个组合扩增出与抗根肿病基因连锁标记。

引用

页码：96 / 101

页数：6

共 12 条

[1] 利用大白菜抗感干烧心病F群体构建AFLP遗传连锁图 [J].

孙秀峰 ;

陈振德 ;

李德全 .

分子植物育种, 2006, (01) :65-70

[2] 利用大白菜DH群体构建AFLP遗传连锁图谱 [J].

张晓芬 ;

王晓武 ;

娄平 ;

张晓伟 ;

王永清 ;

原玉香 ;

赵建军 ;

孙日飞 .

园艺学报, 2005, (03) :443-448

[3] 中国白菜AFLP分子遗传图谱的构建 [J].

王美 ;

张凤兰 ;

孟祥栋 ;

刘秀村 ;

赵岫云 ;

樊治成 .

华北农学报, 2004, (01) :28-33

[4] 大白菜分子遗传图谱的构建与分析 [J].

于拴仓 ;

王永健 ;

郑晓鹰 ;

不详 .

中国农业科学 , 2003, (02) :190-195

[5]

Statistical analysis of vertebrate sequences reveals that long genes are scarce in GC-rich isochores[J] . Laurent Duret,Dominique Mouchiroud,Christian Gautier.Journal of Molecular Evolution . 2004 (3)

[6]

SCAR and CAPS mapping of CRb , a gene conferring resistance to Plasmodiophora brassicae in Chinese cabbage ( Brassica rapa ssp. pekinensis )[J] . Z. Y. Piao,Y. Q. Deng,S. R. Choi,Y. J. Park,Y. P. Lim.Theoretical and Applied Genetics . 2004 (8)

[7] A high-density linkage map in Brassica juncea (Indian mustard) using AFLP and RFLP markers [J].

Pradhan, AK ;

Gupta, V ;

Mukhopadhyay, A ;

Arumugam, N ;

Sodhi, YS ;

Pental, D .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 106 (04) :607-614

[8]

An integrated high-density RFLP-AFLP map of tomato based on two Lycopersicon esculentum×L. pennellii F2 populations[J] . J. P. W. Haanstra,C. Wye,H. Verbakel,F. Meijer-Dekens,P. van den Berg,P. Odinot,A. W. van Heusden,S. Tanksley,P. Lindhout,J. Peleman.TAG Theoretical and Applied Genetics . 1999 (1-2)

[9]

AFLP markers in a molecular linkage map of maize: codominant scoring and linkage group ditsribution[J] . P. Castiglioni,P. Ajmone-Marsan,R. van Wijk,M. Motto.Theoretical and Applied Genetics . 1999 (3)

[10]

Optimization of AFLP fingerprinting of organisms with a large-sized genome: a study on Alstroemeria spp[J] . T. H. Han,H. J. van Eck,M. J. De Jeu,E. Jacobsen.TAG Theoretical and Applied Genetics . 1999 (3-4)

← 1 2 →