池塘养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠含物、附着基和底泥中的菌群结构及其相关性

被引:7
作者
李彬 [1 ]
廖梅杰 [1 ]
荣小军 [1 ]
张正 [1 ]
王印庚 [1 ,2 ]
陈贵平 [1 ]
王岚 [1 ]
范瑞用 [3 ]
机构
[1] 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所
[2] 青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
[3] 青岛瑞滋海珍品发展有限公司
关键词
PCR-DGGE; 仿刺参; 肠含物; 环境; 细菌;
D O I
暂无
中图分类号
S968.9 [其他海产动物养殖];
学科分类号
090807 [水产动物营养与饲料学];
摘要
2014年10月,利用PCR-DGGE技术分析了标准化养殖池塘中仿刺参(Apostichopus japonicus)肠含物及附着基和底泥中细菌的菌群结构及其相关性。结果显示,仿刺参肠含物、附着基、底泥中细菌多样性较高,分别平均获得30.00±1.00、15.33±1.70、21.67±2.62条带,肠含物中细菌种类数显著高于附着基和底泥。聚类分析和戴斯系数表明,不同池塘的仿刺参肠含物样本单独聚为一支,相似性达到0.785,附着基和底泥样品聚为一支,平均相似性达到0.532。不同样品DGGE图谱中20条优势条带的切割、克隆、测序,共获得了20条细菌序列,表明肠含物细菌种类以聚球藻属(Synechococcus sp.)、脱硫杆菌属(Desulfobacterium)、脱硫叠球菌属(Desulfosarcina sp.)、极地杆菌属(Polaribacter)、Algibacter sp.为主,附着基中主要以Robiginitalea sp.和Silicibacter sp.为主,底泥样品中主要以假单胞菌属(Proteobacterium)、噬胞菌属(Cytophaga)、Desulfosarcina sp.为主,肠含物中细菌特有种类的分离与鉴定为仿刺参养殖潜在益生菌的开发提供基础数据。
引用
收藏
页码:127 / 132
页数:6
相关论文
共 17 条
[1]
山东省刺参养殖产业现状分析与可持续发展对策 [J].
李成林 ;
宋爱环 ;
胡炜 ;
张艳萍 ;
赵斌 ;
李翘楚 ;
麻丹萍 .
渔业科学进展, 2010, 31 (04) :126-133
[2]
应用PCR-DGGE指纹技术分析高温季节仿刺参养殖水环境中菌群多样性 [J].
关晓燕 ;
周遵春 ;
陈仲 ;
姜北 ;
汪笑宇 ;
董颖 ;
杨爱馥 ;
邓欢 ;
徐晓红 .
海洋湖沼通报, 2010, (01) :82-88
[3]
凡纳滨对虾海水养殖系统内细菌群落的PCR-DGGE分析 [J].
罗鹏 ;
胡超群 ;
张吕平 ;
任春华 .
中国水产科学, 2009, 16 (01) :31-38
[4]
锯缘青蟹养殖环境中细菌类群及其数量分布 [J].
冯振飞 ;
王国良 ;
钱冬 ;
陈红琴 ;
邱庆连 ;
朱文渊 .
水产科学, 2008, (11) :574-577
[5]
DGGE技术及其在海洋环境微生物多样性研究中的应用 [J].
张振冬 ;
王淑芬 ;
曹宇峰 .
海洋环境科学, 2008, (03) :297-300
[6]
极地微生物的工业应用及其与天体生物学研究的联系 [J].
陈吉刚 ;
杨季芳 .
生命的化学, 2008, (01) :97-100
[7]
仿刺参消化道的组织学及其4种消化酶活力的周年变化 [J].
王吉桥 ;
唐黎 ;
许重 ;
程骏驰 .
水产科学, 2007, (09) :481-484
[8]
渤海湾近岸海域的细菌数量分析 [J].
乔旭东 ;
唐学玺 ;
肖慧 ;
杨震 ;
冯蕾 .
中国海洋大学学报(自然科学版), 2007, (02) :273-276
[9]
PCR-DGGE技术用于湖泊沉积物中微生物群落结构多样性研究 [J].
赵兴青 ;
杨柳燕 ;
陈灿 ;
肖琳 ;
蒋丽娟 ;
马喆 ;
朱昊巍 ;
于振洋 ;
尹大强 .
生态学报, 2006, (11) :3610-3616
[10]
我国土壤中苏云金芽孢杆菌的分离与基因型的鉴定 [J].
罗兰 ;
谢丙炎 ;
袁忠林 ;
杨之为 .
应用与环境生物学报, 2005, (06) :756-759