大型海洋绿藻5.8S rRNA基因序列及系统发育分析

被引:8
作者
沈颂东
张劲
机构
[1] 苏州大学生命科学学院
基金
国家高技术研究发展计划(863计划);
关键词
石莼属; 浒苔属; 礁膜属; 5.8SrRNA; 序列变异; 系统发育;
D O I
暂无
中图分类号
S917.3 [水产植物学];
学科分类号
0908 ;
摘要
采用PCR方法,将扩增的产物直接测序,测定了孔石莼Ulva pertusa和浒苔Enteromorpha prolifera的5.8S rRNA基因序列,与肠浒苔、扁浒苔、缘管浒苔、礁膜、北极礁膜、袋礁膜和格氏礁膜等7种已知的大型海洋绿藻的同一基因序列合并进行比较,分析了核苷酸序列差异和碱基替换特点,并构建系统发生树。结果表明,浒苔和孔石莼的颠换率为0.690%,小于浒苔与肠浒苔、扁浒苔、缘管浒苔的颠换率;且浒苔与孔石莼之间的Kimura双参数距离也小于浒苔与肠浒苔、扁浒苔以及缘管浒苔之间的平均Kimura双参数距离。相对于浒苔属的其他物种,浒苔与孔石莼的亲缘关系更近。在构建的系统发生树中,缘管浒苔与孔石莼聚为一类,表现出与石莼属物种更近的亲缘关系。
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