共 8 条
一种高效可直接用于PCR分析的土壤总微生物DNA抽提方法
被引:27
作者:

李钧敏
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 台州学院生态研究所

金则新
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 台州学院生态研究所
机构:
[1] 台州学院生态研究所
来源:
基金:
浙江省自然科学基金;
关键词:
土壤总微生物;
DNA;
抽提;
PCR扩增;
D O I:
10.13287/j.1001-9332.2006.0415
中图分类号:
S154.3 [土壤微生物学];
学科分类号:
071012 ;
0713 ;
摘要:
以CTAB-溶菌酶-蛋白酶K-冻融裂解法直接抽提土壤总微生物的基因组DNA,利用PEG8000沉淀和纯化DNA.结果表明,该方法是一种简便、有效可直接应用于PCR分析的土壤总微生物基因组DNA的抽提方法.采用含聚乙烯吡咯烷酮(PVP)的缓冲液预洗,添加CaCl2和BSA,可以去除腐殖酸;用PEG8000沉淀DNA,可以提高DNA质量;采用冻融法破碎细胞,CTAB、溶菌酶和蛋白质酶K共同作用以裂解细胞,可以保证获得大片段的DNA,提高DNA产率.用该方法抽提的七子花林下土壤总微生物DNA产率为9·22μg·g-1,A260/A280为1·65,可适用于PCR扩增及扩增rDNA限制酶切分析(ARDRA)技术,适宜的模板DNA浓度为0·67ng·μl-1.快速、有效、可直接用于PCR分析的土壤总微生物DNA提取方法的建立,为大规模的土壤微生物分子生态学研究提供了可能.
引用
收藏
页码:2107 / 2111
页数:5
相关论文
共 8 条
[1]
用于分子生态学研究的土壤微生物DNA提取方法
[J].
张于光
;
李迪强
;
王慧敏
;
肖启明
.
应用生态学报,
2005, (05)
:956-960

张于光
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,湖南农业大学生物安全科技学院,湖南农业大学生物安全科技学院北京,湖南农业大学生物安全科技学院,长沙,北京,长沙,长沙

李迪强
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,湖南农业大学生物安全科技学院,湖南农业大学生物安全科技学院北京,湖南农业大学生物安全科技学院,长沙,北京,长沙,长沙

王慧敏
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,湖南农业大学生物安全科技学院,湖南农业大学生物安全科技学院北京,湖南农业大学生物安全科技学院,长沙,北京,长沙,长沙

肖启明
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,湖南农业大学生物安全科技学院,湖南农业大学生物安全科技学院北京,湖南农业大学生物安全科技学院,长沙,北京,长沙,长沙
[2]
土壤微生物多样性研究方法
[J].
钟文辉
;
蔡祖聪
.
应用生态学报,
2004, (05)
:899-904

论文数: 引用数:
h-index:
机构:

蔡祖聪
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国科学院南京土壤研究所
[3]
土壤微生物总DNA的提取和纯化
[J].
张瑞福
;
曹慧
;
崔中利
;
李顺鹏
;
樊奔
.
微生物学报,
2003, (02)
:276-282

张瑞福
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室

论文数: 引用数:
h-index:
机构:

崔中利
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室

李顺鹏
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室

樊奔
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室
[4]
土壤微生物的分离、提取与纯化研究进展
[J].
向万胜
;
吴金水
;
肖和艾
;
李学垣
.
应用生态学报,
2003, (03)
:453-456

向万胜
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国科学院亚热带区域农业研究所

论文数: 引用数:
h-index:
机构:

肖和艾
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国科学院亚热带区域农业研究所

李学垣
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: 中国科学院亚热带区域农业研究所
[5]
DNA isolation from soil samples for cloning in different hosts
[J].
Kauffmann, IM
;
Schmitt, J
;
Schmid, RD
.
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY,
2004, 64 (05)
:665-670

Kauffmann, IM
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构:
Univ Stuttgart, Inst Tech Biochem, D-70569 Stuttgart, Germany Univ Stuttgart, Inst Tech Biochem, D-70569 Stuttgart, Germany

Schmitt, J
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构:
Univ Stuttgart, Inst Tech Biochem, D-70569 Stuttgart, Germany Univ Stuttgart, Inst Tech Biochem, D-70569 Stuttgart, Germany

Schmid, RD
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构:
Univ Stuttgart, Inst Tech Biochem, D-70569 Stuttgart, Germany Univ Stuttgart, Inst Tech Biochem, D-70569 Stuttgart, Germany
[6]
Soil DNA extraction and assessment of the fate of Mycobacterium chlorophenolicum strain PCP-1 in different soils by 16S ribosomal RNA gene sequence based most-probable-number PCR and immunofluorescence
[J].
vanElsas, JD
;
Mantynen, V
;
Wolters, AC
.
BIOLOGY AND FERTILITY OF SOILS,
1997, 24 (02)
:188-195

vanElsas, JD
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: Res. Institute for Plant Protection, 12 Binnenhaven

Mantynen, V
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: Res. Institute for Plant Protection, 12 Binnenhaven

Wolters, AC
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: Res. Institute for Plant Protection, 12 Binnenhaven
[7]
A simple method of DNA extraction from soil for detection of composite transgenic plants by PCR
[J].
Ernst, D
;
Kiefer, E
;
Drouet, A
;
Sandermann, H
.
PLANT MOLECULAR BIOLOGY REPORTER,
1996, 14 (02)
:143-148

Ernst, D
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: GSF,INST BIOCHEM PFLANZENPATHOL,D-85758 OBERSCHLEISSHEIM,GERMANY

Kiefer, E
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: GSF,INST BIOCHEM PFLANZENPATHOL,D-85758 OBERSCHLEISSHEIM,GERMANY

Drouet, A
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: GSF,INST BIOCHEM PFLANZENPATHOL,D-85758 OBERSCHLEISSHEIM,GERMANY

Sandermann, H
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: GSF,INST BIOCHEM PFLANZENPATHOL,D-85758 OBERSCHLEISSHEIM,GERMANY
[8]
AN EFFECTIVE METHOD TO EXTRACT DNA FROM ENVIRONMENTAL-SAMPLES FOR POLYMERASE CHAIN-REACTION AMPLIFICATION AND DNA FINGERPRINT ANALYSIS
[J].
PORTEOUS, LA
;
ARMSTRONG, JL
;
SEIDLER, RJ
;
WATRUD, LS
.
CURRENT MICROBIOLOGY,
1994, 29 (05)
:301-307

PORTEOUS, LA
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: Biotechnology Program, United States Environmental Protection Agency, Environmental Research Laboratory, Corvallis, 97333, OR

ARMSTRONG, JL
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: Biotechnology Program, United States Environmental Protection Agency, Environmental Research Laboratory, Corvallis, 97333, OR

SEIDLER, RJ
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: Biotechnology Program, United States Environmental Protection Agency, Environmental Research Laboratory, Corvallis, 97333, OR

WATRUD, LS
论文数: 0 引用数: 0
h-index: 0
机构: Biotechnology Program, United States Environmental Protection Agency, Environmental Research Laboratory, Corvallis, 97333, OR