柑桔溃疡病菌实时荧光定量PCR检测与应用

被引:28
作者
殷幼平 [1 ]
黄冠军 [1 ]
赵云 [1 ]
刘洪 [2 ]
王中康 [1 ]
机构
[1] 重庆市基因功能及调控重点实验室重庆大学生物工程学院
[2] 重庆市农业技术推广总站植保植检站
关键词
柑桔溃疡病菌; 定量PCR; 荧光染料; TaqMan探针; 检测;
D O I
10.13802/j.cnki.zwbhxb.2007.06.016
中图分类号
S436.66 [柑桔类病虫害];
学科分类号
090401 ; 090402 ;
摘要
根据地毯草黄单孢Xac306菌株(Xanthomonas axonopodis pv.citri,Xac306)已知全基因组中独有蛋白基因序列设计的特异性引物对和探针,建立并优化SYBR Green I(SGI)荧光染料和Taq-Man探针实时荧光定量PCR检测体系,用于柑桔溃疡病早期诊断鉴定。结果表明,建立的两种定量PCR体系均能特异地检出Xac的细胞和其基因组DNA,而对其它测试的植物病原菌和柑桔表面的腐生黄单孢菌都不能检出。SGI法和TaqMan探针法对Xac细菌悬浮液的检测灵敏度均可达到1~5个细菌/反应,对Xac靶标片段DNA的检测灵敏度可达1fg/μL。两种定量PCR检测方法比常规PCR灵敏度高2~3个数量级。对田间采集的328个柑桔显症、疑似症状和无症带菌材料富集培养样品进行了实际检测,结果表明,实时荧光PCR适合柑桔无症带菌样品的早期检测。
引用
收藏
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页数:7
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共 3 条
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