小片段DNA未知SNPs的PCR SSCP检测方法分析(英文)

被引:2
作者
姜运良
李宁
胡晓湘
吴常信
机构
[1] 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,中国农业大学动物科技学院北京山东农业大学动物生物工程研究室,泰安,北京,北京,北京
基金
国家自然科学基金重点项目;
关键词
小片段DNA; 未知SNPs; PCRSSCP检测;
D O I
10.13865/j.cnki.cjbmb.2002.06.010
中图分类号
Q523 [脱氧核糖核酸(DNA)];
学科分类号
071010 ; 081704 ;
摘要
PCR SSCP是对未知单核苷酸多态性 (SNPs)进行检测最简便、最实用的方法之一 .该方法检测的灵敏度易受片段大小的影响 .以大小在 2 0 0bp左右的PCR扩增产物为检测对象 ,对该方法的影响因素进行了分析 .结果表明 ,在 4℃条件下 ,10V cm恒压电泳 10~ 16h ,在上样缓冲液中加入10 %甘油 ,在 12 %~ 15 %的非变性聚丙烯酰胺 (arc∶bis =2 9∶1)中加入 5 %甘油可改善分辨效果 ,可作为进行小片段DNA单个碱基突变的一般检测方法 .采用该方法在猪的肌肉生长抑制素基因(MSTN)中鉴定了 3个SNPs ,在猪的雌激素受体基因 (ESR)和兔的酪氨酸酶基因中各检测到 1处SNP ,说明该方法在小片段DNA的检测上是行之有效的 ,为基因组中未知SNPs的检测提供了一种简便的方法 .
引用
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