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黄瓜CsEXP10基因的电子克隆及生物信息学分析
被引:7
作者
:
孙涌栋
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机构:
河南科技学院园林学院
河南科技学院园林学院
孙涌栋
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张传来
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罗未蓉
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河南科技学院园林学院
河南科技学院园林学院
罗未蓉
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张兴国
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西南大学园艺园林学院
河南科技学院园林学院
张兴国
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机构
:
[1]
河南科技学院园林学院
[2]
西南大学园艺园林学院
来源
:
生物信息学
|
2008年
/ 03期
关键词
:
黄瓜;
CsEXP10基因;
电子克隆;
生物信息学;
D O I
:
暂无
中图分类号
:
Q943.2 [植物基因工程];
学科分类号
:
071007 ;
090102 ;
摘要
:
以黄瓜CsEXP10 cDNA片段为信息探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得了1191bp的cDNA序列。应用生物信息学软件预测了该蛋白的理化性质、卷曲螺旋、疏水性、信号肽、跨膜结构、糖基位点、活性位点、亚细胞定位及二级和高级结构。结果表明:该蛋白是一个疏水性稳定蛋白,定位于细胞壁,含有4个α-螺旋,11个β-折叠,5个跨膜区域,10个糖基化位点,具有催化域和多糖结合域两个结构域。
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相关论文
共 8 条
[1]
猪CDC16基因的电脑克隆
[J].
马海明
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湖南农业大学动物科技学院
马海明
;
柳小春
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湖南农业大学动物科技学院
柳小春
;
施启顺
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机构:
湖南农业大学动物科技学院
施启顺
.
生物信息学,
2006,
(04)
:150
-152
[2]
授粉后黄瓜果实膨大相关基因的鉴别
[J].
孙涌栋
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机构:
西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
孙涌栋
;
张兴国
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
张兴国
;
侯瑞贤
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
侯瑞贤
;
郭素英
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
郭素英
;
郝风
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
郝风
.
植物生理与分子生物学学报,
2005,
(04)
:403
-408
[3]
小麦中雄性不育同源序列的分离、鉴定及表达分析
[J].
陈军方
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机构:
中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
陈军方
;
任正隆
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
任正隆
;
孔秀英
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
孔秀英
;
吴佳洁
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
吴佳洁
;
周荣华
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
周荣华
;
贾继增
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
贾继增
.
遗传学报,
2005,
(06)
:566
-570
[4]
水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶基因的电子克隆
[J].
刘庆坡
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浙江大学农业与生物技术学院农学系
刘庆坡
;
冯英
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浙江大学农业与生物技术学院农学系
冯英
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董辉
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机构:
浙江大学农业与生物技术学院农学系
董辉
.
生物信息学,
2005,
(01)
:5
-9
[5]
人类TECTB基因的电子克隆
[J].
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机构:
张华莉
;
邓昊
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中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室长沙,长沙,长沙,长沙,长沙
邓昊
;
张瑞芳
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中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室长沙,长沙,长沙,长沙,长沙
张瑞芳
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夏昆
;
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夏家辉
.
遗传学报,
2003,
(04)
:317
-320
[6]
克隆新基因cDNA全长的策略和方法
[J].
樊红
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机构:
哈尔滨医科大学生物教研室黑龙江哈尔滨
樊红
.
国外医学遗传学分册.,
2002,
(01)
:11
-13
[7]
细胞生物学[M]. 高等教育出版社 , 翟中和等主编, 2000
[8]
Expansin protein levels decline with the development of mealiness in peaches
[J].
Obenland, DM
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机构:
USDA ARS, Parlier, CA 93648 USA
Obenland, DM
;
Crisosto, CH
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USDA ARS, Parlier, CA 93648 USA
Crisosto, CH
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Rose, JKC
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USDA ARS, Parlier, CA 93648 USA
Rose, JKC
.
POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY,
2003,
29
(01)
:11
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[1]
猪CDC16基因的电脑克隆
[J].
马海明
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湖南农业大学动物科技学院
马海明
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柳小春
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湖南农业大学动物科技学院
柳小春
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施启顺
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湖南农业大学动物科技学院
施启顺
.
生物信息学,
2006,
(04)
:150
-152
[2]
授粉后黄瓜果实膨大相关基因的鉴别
[J].
孙涌栋
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
孙涌栋
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张兴国
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
张兴国
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侯瑞贤
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
侯瑞贤
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郭素英
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
郭素英
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郝风
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西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室,西南农业大学园艺园林学院,重庆市蔬菜学重点实验室重庆,重庆,重庆,重庆,重庆
郝风
.
植物生理与分子生物学学报,
2005,
(04)
:403
-408
[3]
小麦中雄性不育同源序列的分离、鉴定及表达分析
[J].
陈军方
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
陈军方
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任正隆
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
任正隆
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孔秀英
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
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吴佳洁
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
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周荣华
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
周荣华
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贾继增
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中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,四川农业大学农学院遗传育种系,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,中国农业科学院作物品种资源研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室 北京
贾继增
.
遗传学报,
2005,
(06)
:566
-570
[4]
水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶基因的电子克隆
[J].
刘庆坡
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浙江大学农业与生物技术学院农学系
刘庆坡
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冯英
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浙江大学农业与生物技术学院农学系
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董辉
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机构:
浙江大学农业与生物技术学院农学系
董辉
.
生物信息学,
2005,
(01)
:5
-9
[5]
人类TECTB基因的电子克隆
[J].
论文数:
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机构:
张华莉
;
邓昊
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中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室长沙,长沙,长沙,长沙,长沙
邓昊
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张瑞芳
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中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室,中南大学中国医学遗传学国家重点实验室长沙,长沙,长沙,长沙,长沙
张瑞芳
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夏昆
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机构:
夏家辉
.
遗传学报,
2003,
(04)
:317
-320
[6]
克隆新基因cDNA全长的策略和方法
[J].
樊红
论文数:
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机构:
哈尔滨医科大学生物教研室黑龙江哈尔滨
樊红
.
国外医学遗传学分册.,
2002,
(01)
:11
-13
[7]
细胞生物学[M]. 高等教育出版社 , 翟中和等主编, 2000
[8]
Expansin protein levels decline with the development of mealiness in peaches
[J].
Obenland, DM
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USDA ARS, Parlier, CA 93648 USA
Obenland, DM
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Crisosto, CH
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USDA ARS, Parlier, CA 93648 USA
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Rose, JKC
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USDA ARS, Parlier, CA 93648 USA
Rose, JKC
.
POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY,
2003,
29
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