基于网络药理学和分子对接探寻升降散抗新型冠状病毒潜在作用机制研究

被引：25

作者：

杨小林 ^{[1
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袁永亮 ^{[2
]}

张杰 ^{[3
]}

王如锋 ^{[1
]}

倪力强 ^{[1
]}

机构：

[1] 上海中医药大学

[2] 郑州大学第一附属医院

[3] 中国医科大学第一附属医院

来源：

中草药 | 2020年 / 51卷 / 07期

关键词：

升降散; 新型冠状病毒; 冠状病毒; SARS-CoV-2 3CL水解酶; 血管紧张素转化酶Ⅱ;

D O I：

暂无

中图分类号：

R285 [中药药理学];

学科分类号：

100806 [中药药理学];

摘要：

目的探究升降散抑制新型冠状病毒(SARS-Co V-2)的潜在作用。方法采用ETCM、中药系统药理学分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM和CMAUP数据库获得到升降散复方的靶蛋白基因;采用GeneCards数据库获取抗病毒相关靶基因;采用交集法进而获得升降散复方与抗病毒作用相关的靶基因;运用Cytoscape 3.7.2构建"复方-中药-靶点"网络;运用R语言进行KEGG通路富集分析和GO功能富集分析,预测升降散抗病毒的潜在作用。采用TCMSP、中国知网和Pub Chem数据库检索升降散中的化学成分,将各化学成分与3CL水解酶和血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接。结果升降散复方可能通过663个基因发挥抗病毒作用。KEGG富集筛选得到10条与抗病毒最相关的通路(P<0.01),涉及甲型流感等通路。升降散中与SARS-CoV-2 3CL水解酶和ACE2进行分子对接的结合能数值小于-29.3 kJ/mol的化合物分别有133个和145个。结论升降散可能通过多通路发挥抗病毒作用,对SARS-CoV-2具有潜在的抑制作用。

引用

页码：1795 / 1803

页数：9

共 10 条

[1]

Getting the most out of PubChem for virtual screening [J].