中国2009年甲型H1N1流感病毒进化分析

被引:5
作者
夏晓峰
姚栩
杨建娜
张彩云
陈智伟
郑能雄
机构
[1] 福州市疾病预防控制中心
关键词
猪流感; H1N1; 血凝素; 神经氨酸酶; 基质蛋白; 进化;
D O I
10.16505/j.2095-0136.2010.04.019
中图分类号
R511.7 [流行性感冒];
学科分类号
100401 [流行病与卫生统计学];
摘要
目的研究2009年中国甲型H1N1流感病毒的进化特性和变异情况,为甲型H1N1流感的监控和防治提供科学依据。方法利用ClustaX进行序列比对,以Bioedit软件进行序列同源性分析,使用Mega 4.0软件采用邻位相连算法构建进化树,对2009年登录在Genbank数据库中的中国甲型H1N1流感病毒的HA、NA、M蛋白的氨基酸序列进行系统进化分析。结果中国2009年甲型H1N1流感病毒分离株与美国分离株[A/California/04/2009(H1N1)]具有很近的亲缘关系,不同省份分离株之间的HA、NA、M蛋白相互交叉渗透,但同时各个省份间暴发的H1N1流感病毒的HA蛋白又具有一定的聚集性。香港分离株[A/Hong Kong/2369/2009(H1N1)]和上海分离株[A/Shanghai/LWS1/2009(H1N1)]产生了对达菲的耐药性,其他毒株仍然敏感;上海分离株[A/Shanghai/LWS1/2009(H1N1)]对金刚烷胺类药物敏感,其余毒株均对其耐药。结论本研究表明,中国2009年甲型H1N1流感病毒不仅具有很强的保守性,同时又具有一定的区域特异性,毒株相对稳定,没有出现大的变异。
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