红豆杉科及三尖杉科的分子系统发育——兼论竹柏属的系统位置

测定了红豆杉科、三尖杉科、罗汉松科及松科共 9属 1 3种植物的matK基因序列 ,发现 3′端的单碱基插入造成matK基因在这些类群间有较大的长度变异 ( 1 488～ 1 548bp) ,其它插入或缺失的长度为 3、6或 9bp(白豆杉中有一个长为 2 7bp的缺失 ) ,且绝大多数插入或缺失事件具有系统发育信息。matK基因中 ,密码子第 1、2及 3位的变异率较为相近 ,平均同义替代率约为平均非同义替代率的 2倍。以松科2属 3种植物为外类群 ,运用PAUP软件进行的系统发育分析仅得到一棵最简约树 (步长为 895,CI =0 850 ,RI=0 876) ,该简约树的各分支均得到bootstrap分析的极强支持。结果表明 :红豆杉科与三尖杉科均为单系群 ,二者互为姐妹群 ;白豆杉属与穗花杉属为红豆杉科中两个很自然的属 ,白豆杉属为红豆杉属的姐妹群 ,穗花杉属为榧树属的姐妹群。竹柏属与罗汉松属聚为一支 ,二者间的亲缘关系得到boot strap分析的 1 0 0 %支持 ,从分支分类学及遗传距离角度 ,作者不赞同将竹柏属提升为科。