基于SSR荧光标记技术的玉米群体混合样本基因频率分析方法

被引：18

作者：

刘晓鑫 ^{[1
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谢传晓 ^{[1
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赵琦 ^{[3
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路明 ^{[1
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曲延英 ^{[2
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张滨 ^{[3
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梁业红 ^{[1
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张世煌 ^{[1
]}

机构：

[1] 中国农业科学院作物科学研究所玉米研究中心/农业部作物遗传育种学重点实验室

[2] 新疆农业大学

[3] 首都师范大学

来源：

中国农业科学 | 2008年 / 41卷 / 12期

关键词：

荧光SSR; 玉米群体; 混合样本; 基因频率;

D O I：

暂无

中图分类号：

S513 [玉米（玉蜀黍）];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

【目的】建立玉米群体混合样本等位基因及其频率的分析方法。【方法】采用ABI全自动遗传分析仪,利用5′端荧光标记的SSR引物,通过混合样本中PCR扩增产物检测峰高与丰度对应,分析基因频率。【结果】与聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法相比,ABI全自动遗传分析仪的检测灵敏度高。20个供试玉米群体中,荧光引物Phi072(6-Fam)共检测到82个等位基因位点,平均每个群体4.1个;引物Phi084(Hex)检测到43个等位基因位点,平均每个群体2.15个。多重PCR(multiplex PCR)荧光SSR检测结果显示,可以明确区分不同等位基因。荧光SSR能准确地读出片段大小,定量PCR扩增产物的丰度。用GeneScan获取数据,用Genotyper软件对数据进行设置与输出,使用R软件的FREQS-R模块,初步探讨利用荧光SSR定量化数据,计算供试群体15个单株混合样本的等位基因频率。【结论】可通过荧光SSR产物的丰度来确定混合取样群体的基因频率。

引用

页码：3991 / 3998

页数：8

共 9 条

[1] 利用SSR标记分析玉米群体遗传变异的取样方法 [J].