犬瘟热病毒Guizhou株血凝素基因的克隆及序列分析

被引:8
作者
朱军莉 [1 ]
余旭平 [1 ]
张登祥 [2 ]
沈琴芳 [1 ]
徐在平 [2 ]
李永明 [2 ]
周碧君 [2 ]
吴彤 [2 ]
机构
[1] 浙江大学动物科学学院
[2] 贵州大学动物科学学院
关键词
犬瘟热病毒; H基因; 序列分析; 同源性;
D O I
10.16303/j.cnki.1005-4545.2006.01.006
中图分类号
S852.65 [家畜病毒学];
学科分类号
090601 ;
摘要
参照已发表的文献合成1对引物,以犬瘟热病毒Guizhou分离株感染Vero细胞收获病毒提取的RNA为模板,RT-PCR扩增获得血凝素蛋白基因(H)901~1661位大小为761bp的片段,并将PCR扩增产物进行克隆和测序。将Guizhou株与GenBank数据库中的31株CDV及国内Nanjing OP株的H基因序列进行同源性和系统发生树分析,发现Guizhou株的H基因部分序列与疫苗毒株Convac和Onderstpoort的同源性最低,只有90%;与日本野毒株Tanu96、KDK-1、Hmanatsu、Yanaka、UENO的同源性较高,为96%98%;且与国内从大熊猫和小熊猫分离的野毒株GP和LP的同源性也较高,为98%和96%。系统发生树分析显示,Guizhou株与国内野毒株GP和LP,及日本的5个野毒株应属同一类,其中和GP株基因型最近,推测这些毒株间有更近的共同祖先。因此怀疑该病毒较适应于野生动物,且在我国某些地区的野生动物中可能存在自然疫源性传播。
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