Genome update:: distribution of two-component transduction systems in 250 bacterial genomes

被引：23

作者：

Kiil, K ^{[1
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Ferchaud, JB ^{[1
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David, C ^{[1
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Binnewies, TT ^{[1
]}

Wu, H ^{[1
]}

Sicheritz-Pontén, T ^{[1
]}

Willenbrock, H ^{[1
]}

Ussery, DW ^{[1
]}

机构：

[1] Tech Univ Denmark, BioCtr, Ctr Biol Sequence Anal, DK-2800 Lyngby, Denmark

来源：

MICROBIOLOGY-SGM | 2005年 / 151卷

关键词：

D O I：

10.1099/mic.0.28423-0

中图分类号：

Q93 [微生物学];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

引用

页码：3447 / 3452

页数：6

共 13 条

[1] The genome of the African trypanosome Trypanosoma brucei [J].

Berriman, M ;

Ghedin, E ;

Hertz-Fowler, C ;

Blandin, G ;

Renauld, H ;

Bartholomeu, DC ;

Lennard, NJ ;

Caler, E ;

Hamlin, NE ;

Haas, B ;

Böhme, W ;

Hannick, L ;

Aslett, MA ;

Shallom, J ;

Marcello, L ;

Hou, LH ;

Wickstead, B ;

Alsmark, UCM ;

Arrowsmith, C ;

Atkin, RJ ;

Barron, AJ ;

Bringaud, F ;

Brooks, K ;

Carrington, M ;

Cherevach, I ;

Chillingworth, TJ ;

Churcher, C ;

Clark, LN ;

Corton, CH ;

Cronin, A ;

Davies, RM ;

Doggett, J ;

Djikeng, A ;

Feldblyum, T ;

Field, MC ;

Fraser, A ;

Goodhead, I ;

Hance, Z ;

Harper, D ;

Harris, BR ;

Hauser, H ;

Hostetter, J ;

Ivens, A ;

Jagels, K ;

Johnson, D ;

Johnson, J ;

Jones, K ;

Kerhornou, AX ;

Koo, H ;

Larke, N .

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[2] Genome sequence of Blochmannia pennsylvanicus indicates parallel evolutionary trends among bacterial mutualists of insects [J].

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[3] Comparative genomics of trypanosomatid parasitic protozoa [J].

El-Sayed, NM ;

Myler, PJ ;

Blandin, G ;

Berriman, M ;

Crabtree, J ;

Aggarwal, G ;

Caler, E ;

Renauld, H ;

Worthey, EA ;

Hertz-Fowler, C ;

Ghedin, E ;

Peacock, C ;

Bartholomeu, DC ;

Haas, BJ ;

Tran, AN ;

Wortman, JR ;

Alsmark, UCM ;

Angiuoli, S ;

Anupama, A ;

Badger, J ;

Bringaud, F ;

Cadag, E ;

Carlton, JM ;

Cerqueira, GC ;

Creasy, T ;

Delcher, AL ;

Djikeng, A ;

Embley, TM ;

Hauser, C ;

Ivens, AC ;

Kummerfeld, SK ;

Pereira-Leal, JB ;

Nilsson, D ;

Peterson, J ;

Salzberg, SL ;

Shallom, J ;

Silva, JC ;

Sundaram, J ;

Westenberger, S ;

White, O ;

Metville, SE ;

Donelson, JE ;

Andersson, B ;

Stuart, KD ;

Hall, N .

SCIENCE, 2005, 309 (5733) :404-409

[4] The genome sequence of Trypanosoma cruzi, etiologic agent of Chagas disease [J].

El-Sayed, NM ;

Myler, PJ ;

Bartholomeu, DC ;

Nilsson, D ;

Aggarwal, G ;

Tran, AN ;

Ghedin, E ;

Worthey, EA ;

Delcher, AL ;

Blandin, G ;

Westenberger, SJ ;

Caler, E ;

Cerqueira, GC ;

Branche, C ;

Haas, B ;

Anupama, A ;

Arner, E ;

Åslund, L ;

Attipoe, P ;

Bontempi, E ;

Bringaud, F ;

Burton, P ;

Cadag, E ;

Campbell, DA ;

Carrington, M ;

Crabtree, J ;

Darban, H ;

da Silveira, JF ;

de Jong, P ;

Edwards, K ;

Englund, PT ;

Fazelina, G ;

Feldblyum, T ;

Ferella, M ;

Frasch, AC ;

Gull, K ;

Horn, D ;

Hou, LH ;

Huang, YT ;

Kindlund, E ;

Ktingbeil, M ;

Kluge, S ;

Koo, H ;

Lacerda, D ;

Levin, MJ ;

Lorenzi, H ;

Louie, T ;

Machado, CR ;

McCulloch, R ;

McKenna, A .

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[5] Comparison of the complete genome sequences of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a and pv. tomato DC3000 [J].

Feil, H ;

Feil, WS ;

Chain, P ;

Larimer, F ;

DiBartolo, G ;

Copeland, A ;

Lykidis, A ;

Trong, S ;

Nolan, M ;

Goltsman, E ;

Thiel, J ;

Malfatti, S ;

Loper, JE ;

Lapidus, A ;

Detter, JC ;

Land, M ;

Richardson, PM ;

Kyrpides, NC ;

Ivanova, N ;

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[6] The genome of the kinetoplastid parasite, Leishmania major [J].

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Peacock, CS ;

Worthey, EA ;

Murphy, L ;

Aggarwal, G ;

Berriman, M ;

Sisk, E ;

Rajandream, MA ;

Adlem, E ;

Aert, R ;

Anupama, A ;

Apostolou, Z ;

Attipoe, P ;

Bason, N ;

Bauser, C ;

Beck, A ;

Beverley, SM ;

Bianchettin, G ;

Borzym, K ;

Bothe, G ;

Bruschi, CV ;

Collins, M ;

Cadag, E ;

Ciarloni, L ;

Clayton, C ;

Coulson, RMR ;

Cronin, A ;

Cruz, AK ;

Davies, RM ;

De Gaudenzi, J ;

Dobson, DE ;

Duesterhoeft, A ;

Fazelina, G ;

Fosker, N ;

Frasch, AC ;

Fraser, A ;

Fuchs, M ;

Gabel, C ;

Goble, A ;

Goffeau, A ;

Harris, D ;

Hertz-Fowler, C ;

Hilbert, H ;

Horn, D ;

Huang, YT ;

Klages, S ;

Knights, A ;

Kube, M ;

Larke, N ;

Litvin, L .

SCIENCE, 2005, 309 (5733) :436-442

[7] Genome update:: sigma factors in 240 bacterial genomes [J].

Kill, K ;

Binnewies, TT ;

Sicheritz-Pontén, T ;

Willenbrock, H ;

Hallin, PF ;

Wassenaart, TM ;

Ussery, DW .

MICROBIOLOGY-SGM, 2005, 151 :3147-3150

[8] Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors [J].

Margulies, M ;

Egholm, M ;

Altman, WE ;

Attiya, S ;

Bader, JS ;

Bemben, LA ;

Berka, J ;

Braverman, MS ;

Chen, YJ ;

Chen, ZT ;

Dewell, SB ;

Du, L ;

Fierro, JM ;

Gomes, XV ;

Godwin, BC ;

He, W ;

Helgesen, S ;

Ho, CH ;

Irzyk, GP ;

Jando, SC ;

Alenquer, MLI ;

Jarvie, TP ;

Jirage, KB ;

Kim, JB ;

Knight, JR ;

Lanza, JR ;

Leamon, JH ;

Lefkowitz, SM ;

Lei, M ;

Li, J ;

Lohman, KL ;

Lu, H ;

Makhijani, VB ;

McDade, KE ;

McKenna, MP ;

Myers, EW ;

Nickerson, E ;

Nobile, JR ;

Plant, R ;

Puc, BP ;

Ronan, MT ;

Roth, GT ;

Sarkis, GJ ;

Simons, JF ;

Simpson, JW ;

Srinivasan, M ;

Tartaro, KR ;

Tomasz, A ;

Vogt, KA ;

Volkmer, GA .

NATURE, 2005, 437 (7057) :376-380

[9] The psychrophilic lifestyle as revealed by the genome sequence of Colwellia psychrerythraea 34H through genomic and proteomic analyses [J].

Methé, BA ;

Nelson, KE ;

Deming, JW ;

Momen, B ;

Melamud, E ;

Zhang, XJ ;

Moult, J ;

Madupu, R ;

Nelson, WC ;

Dodson, RJ ;

Brinkac, LM ;

Daugherty, SC ;

Durkin, AS ;

DeBoy, RT ;

Kolonay, JF ;

Sullivan, SA ;

Zhou, LW ;

Davidsen, TM ;

Wu, M ;

Huston, AL ;

Lewis, M ;

Weaver, B ;

Weidman, JF ;

Khouri, H ;

Utterback, TR ;

Feldblyum, TV ;

Fraser, CM .

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2005, 102 (31) :10913-10918

[10]

Pennisi E, 2005, SCIENCE, V309, P862

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