大型真菌的生态多样性及分子鉴定

被引:0
作者
林晓民
机构
[1] 西北农林科技大学
关键词
大型真菌; 生态多样性; 分子鉴定; 内转录间隔区; DNA 序列; 外生菌根菌;
D O I
暂无
年度学位
2004
学位类型
博士
导师
摘要
本研究包括大型真菌的生态多样性调查和菌丝体的分子鉴定两部分,现分述摘要如 下: (一)大型真菌的生态多样性调查 调查了 422 种大型真菌的生境、生态,按生态习性将这 422 种大型真菌分为 12 个 生态类型,即土壤腐生菌、木腐菌、落叶及腐草生菌、粪生菌、植物寄生菌、昆虫寄生 菌、真菌寄生菌、地衣型真菌、外生菌根菌、昆虫共生菌、天麻共生菌和真菌共生菌。 结合 94 幅典型照片对中国大型真菌的生态多样做了初步阐述,并对大型真菌生态多样 性的研究方法进行了讨论。 (二)大型真菌菌丝体的分子鉴定 大型真菌的菌种一般都是菌丝体,而传统的真菌种类鉴定主要是依据子实体的特 征,菌丝体不能直接用于种类鉴定。对于能用人工培养方法生产子实体的种类,可通过 出菇试验对菌种进行种类鉴定,但这种鉴定方法花费的时间较长,往往需要一个月以上 甚至一年的时间。对于尚不能用人工培养方法生产子实体的种类,则不能用这种常规方 法进行菌种鉴定。分子鉴定技术可以对菌丝体进行种类鉴定,但过去文献上报道的大型 真菌分子鉴定多是采用RAPD和ITS-RFLP等方法,这些方法除了精确性与重复性较差外, 还需要以同种真菌的子实体作对照,不同条件下的研究结果缺乏可比性。 本研究是基于 rDNA ITS 区段的 DNA 序列对菌丝体进行物种鉴定,其方法是先扩增 出待鉴定真菌 rDNA ITS 区段的 DNA,并测出其序列,然后与互联网上 DNA 序列数据库 中的信息资源进行比较,从而得出物种鉴定的结论。 运用该方法首先对出菇试验证实了的 3 种栽培食用菌(桃红侧耳、白阿魏侧耳和杏 鲍菇)的菌种进行了物种鉴定,分子鉴定结果与出菇试验的鉴定结果相一致,证明这种 分子鉴定方法是切实可行的,鉴定结果是可靠的。然后进一步用该方法对分离自 6 种外 生菌根菌子实体的菌株进行了分子鉴定,结果表明:分离自松口蘑(Tricholoma matsutake)子实体的 1 个菌株被证实为真正的松口蘑菌种,分离自其它 5 种外生菌根 菌子实体的菌丝体均被证明不是原分离子实体所属物种的菌种。其中分离自褐环乳牛肝 菌[Suillus luteus (L.:Fr.)Gray]子实体的 1 个菌株被证实是裂褶菌(S. commune), 该分子鉴定结果进一步得到了出菇试验的支持;分离自干巴菌(Telephore ganbajun) 子实体的 1 个菌株被证实为一种镰刀菌(Fusarium sp.),该分子鉴定结果进一步得到 了形态鉴定的支持;分别分离自厚环乳牛肝菌[Suillus grevillei (Klotzsch.)Sing.] 和玫红铆钉菇[G. roseus (Fr.)Karst.] 子实体的 2 个菌株经分子鉴定它们 ITS 区段 的 DNA 序列完全相同,该 DNA 序列与互联网上 DNA 序列数据库中一种内生真菌 (Endophytic fungi )的相应序列具有高度的同源性 [96.61% (599/620)],该内生 ii 大型真菌的生态多样性及分子鉴定 真菌分离自我国台湾的珍稀植物南方红豆杉(Taxus mairei),属于一种未鉴定出种类 的担子菌;分离自污白疣柄牛肝菌[Leccinum holopus (Rostk. ) Watl.]子实体的 1 个 菌株的 ITS 区段 DNA 序列与互联网上序列数据库中的所有 DNA 序列同源性均较低,最高 同源性约为 78%,这些同源序列均属于子囊菌。 此外,以茯苓基因组 DNA 为模版,用通用引物 ITS1/ITS4 能扩增出了一条约 1700bp 的特异性 DNA 片段,经 PCR 产物直接测序,测出了 2 条具有茯苓物种特异性的 DNA 序列, 这两方面的 DNA 分子特征可作为茯苓物种鉴定的分子依据。
引用
收藏
页数:147
共 142 条
[1]
腐生与共生食用菌菌丝体分离、培养及其DNA鉴定研究 [D]. 
曾东方 .
华中农业大学,
2000
[2]
分子遗传学.[M].李振刚编著;.科学出版社.2000,
[3]
普通真菌学.[M].邢来君;李明春编著;.高等教育出版社.1999,
[4]
菌根研究及应用.[M].弓明钦等编著;.中国林业出版社.1997,
[5]
中国食用菌百科.[M].黄年来主编;.农业出版社.1993,
[6]
真核生物基因的结构与功能.[M].敖世洲等编著;.科学出版社.1989,
[7]
真菌的形态和分类.[M].戴芳澜 著.科学出版社.1987,
[8]
A nested-intensity design for surveying plant diversity [J].
Barnett, DT ;
Stohlgren, TJ .
BIODIVERSITY AND CONSERVATION, 2003, 12 (02) :255-278
[9]
Large mammalian herbivores and woody plant species diversity in Zimbabwe [J].
Richardson-Kageler, SJ .
BIODIVERSITY AND CONSERVATION, 2003, 12 (04) :703-715
[10]
Species richness of gall-forming insects in a tropical rain forest:: correlations with plant diversity and soil fertility [J].
Cuevas-Reyes, P ;
Siebe, C ;
Martínez-Ramos, M ;
Oyama, K .
BIODIVERSITY AND CONSERVATION, 2003, 12 (03) :411-422