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蜡梅开花过程基因表达的ESTs分析与凝集素基因功能的初步鉴定
被引:0
作者
:
论文数:
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机构:
眭顺照
机构
:
[1]
西南大学
关键词
:
cDNA文库;
EST分析;
凝集素基因;
抗虫;
蜡梅;
D O I
:
暂无
年度学位
:
2006
学位类型
:
博士
导师
:
李名扬;
摘要
:
蜡梅(Chimonanthus praecox (L.) Link)是蜡梅科(Calycanthaceae)蜡梅属(Chimonanthus Lindl.)植物,为原产我国的落叶丛生灌木。蜡梅花在12月至翌年早春2月孕蕾开花、花香宜人以及其特殊的抗逆性状令人关注。目前人们对蜡梅开花与花香形成的分子机理研究缺乏,没有从蜡梅中克隆到抗逆基因的报道,对蜡梅开花过程中的基因表达情况不清楚。本论文从构建蜡梅花cDNA文库入手,利用EST技术分析开花过程中的基因表达情况,在此基础上,克隆蜡梅凝集素基因,利用转基因手段初步分析其抗虫性。主要取得以下结果: 1.蜡梅花cDNA文库构建 用SMART cDNA文库构建试剂盒成功构建了蕾期、露瓣期、初开期、盛开期蜡梅花混合cDNA文库。原始文库滴度达到1.4×10~6pfu/ml,扩增文库滴度约为1010pfu/ml,重组率达96%,插入片段在0.5 kb以上,平均约1.1kb。通过PCR检测,从扩增文库中检测到了蜡梅PI、AP3和LTP基因的特异片段,说明所构建的文库覆盖度高、代表性强。LTP基因具有内含子,而通过PCR从文库中扩增出的LTP基因不含内含子,说明所构建的cDNA文库无基因组DNA污染。这是第一次正式报道蜡梅cDNA文库的构建。 2.蜡梅花EST序列测定与拼接 从蜡梅花cDNA文库首先挑取噬菌斑克隆,然后转变为质粒,PCR筛选阳性克隆进行正向序列测定获得了896个原始序列,经SeqMan、BLAST分析后得到蜡梅花的有效EST序列867条,有效率为96.76%。全部片段长为584201bp,平均读长为673.8bp。进而转化成GenBank提交格式提交GenBank数据库,登录号从DW222667到DW223533。 利用DNASTAR软件包的SeqMan Ⅱ程序对867条有效EST序列进行序列拼接后得到479个不同的独立基因(contigs,含singlet),冗余序列占全部序列的44.8%。 根据不同独立基因(contigs,含singlet)的EST数量统计,蜡梅开花过程低丰度表达
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页数:129
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[1]
蜡梅种子抑菌成分研究
[J].
张继文
论文数:
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机构:
西北农林科技大学生命科学学院
张继文
;
杨春平
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西北农林科技大学生命科学学院
杨春平
;
潘朝
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西北农林科技大学生命科学学院
潘朝
;
吴文君
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机构:
西北农林科技大学生命科学学院
吴文君
.
西北植物学报,
2005,
(10)
:2068
-2071
[2]
植物水孔蛋白
[J].
论文数:
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机构:
朱珠
;
论文数:
引用数:
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机构:
郑海雷
.
细胞生物学杂志,
2005,
(05)
:539
-544
[3]
蜡梅切花观赏特性的综合评价
[J].
论文数:
引用数:
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机构:
王菲彬
;
论文数:
引用数:
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机构:
芦建国
.
林业科技开发,
2005,
(05)
:25
-27
[4]
植物富含甘氨酸蛋白质(GRP)及其基因研究进展
[J].
陈万利
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机构:
东北农业大学农学院
陈万利
;
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机构:
刘宗旨
;
李文华
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机构:
东北农业大学农学院
李文华
.
东北农业大学学报,
2005,
(04)
:512
-519
[5]
蜡梅枝芽特性及扦插繁殖试验
[J].
胡宜先
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机构:
长江大学后勤集团
胡宜先
;
潘佑找
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长江大学后勤集团
潘佑找
;
刘孝石
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机构:
长江大学后勤集团
刘孝石
.
长江大学学报(自科版),
2005,
(08)
:28
-29+32
[6]
植物来源抗虫基因的应用
[J].
赵强
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山东农业大学生命科学学院
赵强
;
张廷婷
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山东农业大学生命科学学院
张廷婷
;
崔德才
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机构:
山东农业大学生命科学学院
崔德才
.
生物技术通讯,
2005,
(04)
:456
-459
[7]
两种凝集素基因在转基因烟草中表达的研究
[J].
刘召华
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机构:
中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,北京师范大学生命科学学院,中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室,北京,北京师范大学生命科学学院,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京
刘召华
;
张振山
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机构:
中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,北京师范大学生命科学学院,中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室,北京,北京师范大学生命科学学院,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京
张振山
;
论文数:
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机构:
郭洪年
;
论文数:
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机构:
贾燕涛
;
郑光宇
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中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,北京师范大学生命科学学院,中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室,北京,北京师范大学生命科学学院,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京
郑光宇
;
论文数:
引用数:
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机构:
田颖川
.
遗传学报,
2005,
(07)
:758
-763
[8]
金属硫蛋白的功能及应用前景
[J].
论文数:
引用数:
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机构:
张桂春
.
烟台师范学院学报(自然科学版),
2005,
(02)
:142
-145
[9]
生长素反应因子
[J].
吴蓓
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机构:
中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,香港理工大学应用生物及化学科学技术系,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室广州,香港九龙,广州,广州,广州
吴蓓
;
吴建勇
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机构:
中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,香港理工大学应用生物及化学科学技术系,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室广州,香港九龙,广州,广州,广州
吴建勇
;
蔡刘体
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机构:
中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,香港理工大学应用生物及化学科学技术系,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室广州,香港九龙,广州,广州,广州
蔡刘体
;
论文数:
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机构:
李运合
;
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机构:
黄学林
.
植物生理学通讯,
2005,
(03)
:273
-278
[10]
茶树新梢cDNA克隆测序和表达序列标签(ESTs)特性分析
[J].
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机构:
陈亮
;
赵丽萍
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中国农业科学院茶叶研究所农业部茶叶化学工程重点实验室,中国农业科学院茶叶研究所农业部茶叶化学工程重点实验室,浙江大学分析测试中心杭州,杭州,杭州
赵丽萍
;
论文数:
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机构:
高其康
.
农业生物技术学报,
2005,
(01)
:21
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[1]
蜡梅种子抑菌成分研究
[J].
张继文
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机构:
西北农林科技大学生命科学学院
张继文
;
杨春平
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西北农林科技大学生命科学学院
杨春平
;
潘朝
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西北农林科技大学生命科学学院
潘朝
;
吴文君
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机构:
西北农林科技大学生命科学学院
吴文君
.
西北植物学报,
2005,
(10)
:2068
-2071
[2]
植物水孔蛋白
[J].
论文数:
引用数:
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机构:
朱珠
;
论文数:
引用数:
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机构:
郑海雷
.
细胞生物学杂志,
2005,
(05)
:539
-544
[3]
蜡梅切花观赏特性的综合评价
[J].
论文数:
引用数:
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机构:
王菲彬
;
论文数:
引用数:
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机构:
芦建国
.
林业科技开发,
2005,
(05)
:25
-27
[4]
植物富含甘氨酸蛋白质(GRP)及其基因研究进展
[J].
陈万利
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东北农业大学农学院
陈万利
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刘宗旨
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李文华
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东北农业大学农学院
李文华
.
东北农业大学学报,
2005,
(04)
:512
-519
[5]
蜡梅枝芽特性及扦插繁殖试验
[J].
胡宜先
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长江大学后勤集团
胡宜先
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潘佑找
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潘佑找
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刘孝石
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长江大学后勤集团
刘孝石
.
长江大学学报(自科版),
2005,
(08)
:28
-29+32
[6]
植物来源抗虫基因的应用
[J].
赵强
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山东农业大学生命科学学院
赵强
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张廷婷
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山东农业大学生命科学学院
张廷婷
;
崔德才
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山东农业大学生命科学学院
崔德才
.
生物技术通讯,
2005,
(04)
:456
-459
[7]
两种凝集素基因在转基因烟草中表达的研究
[J].
刘召华
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中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,北京师范大学生命科学学院,中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室,北京,北京师范大学生命科学学院,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京
刘召华
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张振山
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中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,中国科学院微生物研究所,北京师范大学生命科学学院,中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室,北京,北京师范大学生命科学学院,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京,北京,植物基因组学国家重点实验室,北京
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郭洪年
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郑光宇
;
论文数:
引用数:
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机构:
田颖川
.
遗传学报,
2005,
(07)
:758
-763
[8]
金属硫蛋白的功能及应用前景
[J].
论文数:
引用数:
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机构:
张桂春
.
烟台师范学院学报(自然科学版),
2005,
(02)
:142
-145
[9]
生长素反应因子
[J].
吴蓓
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中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,香港理工大学应用生物及化学科学技术系,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室广州,香港九龙,广州,广州,广州
吴蓓
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吴建勇
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中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,香港理工大学应用生物及化学科学技术系,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室广州,香港九龙,广州,广州,广州
吴建勇
;
蔡刘体
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机构:
中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,香港理工大学应用生物及化学科学技术系,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室广州,香港九龙,广州,广州,广州
蔡刘体
;
论文数:
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机构:
李运合
;
论文数:
引用数:
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机构:
黄学林
.
植物生理学通讯,
2005,
(03)
:273
-278
[10]
茶树新梢cDNA克隆测序和表达序列标签(ESTs)特性分析
[J].
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机构:
陈亮
;
赵丽萍
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中国农业科学院茶叶研究所农业部茶叶化学工程重点实验室,中国农业科学院茶叶研究所农业部茶叶化学工程重点实验室,浙江大学分析测试中心杭州,杭州,杭州
赵丽萍
;
论文数:
引用数:
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机构:
高其康
.
农业生物技术学报,
2005,
(01)
:21
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