蜡梅开花过程基因表达的ESTs分析与凝集素基因功能的初步鉴定

被引:0
作者
眭顺照
机构
[1] 西南大学
关键词
cDNA文库; EST分析; 凝集素基因; 抗虫; 蜡梅;
D O I
暂无
年度学位
2006
学位类型
博士
导师
摘要
蜡梅(Chimonanthus praecox (L.) Link)是蜡梅科(Calycanthaceae)蜡梅属(Chimonanthus Lindl.)植物,为原产我国的落叶丛生灌木。蜡梅花在12月至翌年早春2月孕蕾开花、花香宜人以及其特殊的抗逆性状令人关注。目前人们对蜡梅开花与花香形成的分子机理研究缺乏,没有从蜡梅中克隆到抗逆基因的报道,对蜡梅开花过程中的基因表达情况不清楚。本论文从构建蜡梅花cDNA文库入手,利用EST技术分析开花过程中的基因表达情况,在此基础上,克隆蜡梅凝集素基因,利用转基因手段初步分析其抗虫性。主要取得以下结果: 1.蜡梅花cDNA文库构建 用SMART cDNA文库构建试剂盒成功构建了蕾期、露瓣期、初开期、盛开期蜡梅花混合cDNA文库。原始文库滴度达到1.4×10~6pfu/ml,扩增文库滴度约为1010pfu/ml,重组率达96%,插入片段在0.5 kb以上,平均约1.1kb。通过PCR检测,从扩增文库中检测到了蜡梅PI、AP3和LTP基因的特异片段,说明所构建的文库覆盖度高、代表性强。LTP基因具有内含子,而通过PCR从文库中扩增出的LTP基因不含内含子,说明所构建的cDNA文库无基因组DNA污染。这是第一次正式报道蜡梅cDNA文库的构建。 2.蜡梅花EST序列测定与拼接 从蜡梅花cDNA文库首先挑取噬菌斑克隆,然后转变为质粒,PCR筛选阳性克隆进行正向序列测定获得了896个原始序列,经SeqMan、BLAST分析后得到蜡梅花的有效EST序列867条,有效率为96.76%。全部片段长为584201bp,平均读长为673.8bp。进而转化成GenBank提交格式提交GenBank数据库,登录号从DW222667到DW223533。 利用DNASTAR软件包的SeqMan Ⅱ程序对867条有效EST序列进行序列拼接后得到479个不同的独立基因(contigs,含singlet),冗余序列占全部序列的44.8%。 根据不同独立基因(contigs,含singlet)的EST数量统计,蜡梅开花过程低丰度表达
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共 94 条
[1]
蜡梅种子抑菌成分研究 [J].
张继文 ;
杨春平 ;
潘朝 ;
吴文君 .
西北植物学报, 2005, (10) :2068-2071
[2]
植物水孔蛋白 [J].
朱珠 ;
郑海雷 .
细胞生物学杂志, 2005, (05) :539-544
[3]
蜡梅切花观赏特性的综合评价 [J].
王菲彬 ;
芦建国 .
林业科技开发, 2005, (05) :25-27
[4]
植物富含甘氨酸蛋白质(GRP)及其基因研究进展 [J].
陈万利 ;
刘宗旨 ;
李文华 .
东北农业大学学报, 2005, (04) :512-519
[5]
蜡梅枝芽特性及扦插繁殖试验 [J].
胡宜先 ;
潘佑找 ;
刘孝石 .
长江大学学报(自科版), 2005, (08) :28-29+32
[6]
植物来源抗虫基因的应用 [J].
赵强 ;
张廷婷 ;
崔德才 .
生物技术通讯, 2005, (04) :456-459
[7]
两种凝集素基因在转基因烟草中表达的研究 [J].
刘召华 ;
张振山 ;
郭洪年 ;
贾燕涛 ;
郑光宇 ;
田颖川 .
遗传学报, 2005, (07) :758-763
[8]
金属硫蛋白的功能及应用前景 [J].
张桂春 .
烟台师范学院学报(自然科学版), 2005, (02) :142-145
[9]
生长素反应因子 [J].
吴蓓 ;
吴建勇 ;
蔡刘体 ;
李运合 ;
黄学林 .
植物生理学通讯, 2005, (03) :273-278
[10]
茶树新梢cDNA克隆测序和表达序列标签(ESTs)特性分析 [J].
陈亮 ;
赵丽萍 ;
高其康 .
农业生物技术学报, 2005, (01) :21-25