水稻籼粳交F8、F2群体穗长QTL比较分析

被引：12

作者：

郭小蛟 ^{[1
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张涛 ^{[2
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蒋开锋 ^{[2
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杨莉 ^{[2
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曹应江 ^{[2
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杨乾华 ^{[2
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游书梅 ^{[2
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万先齐 ^{[3
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罗婧 ^{[2
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李昭祥 ^{[2
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高磊 ^{[2
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郑家奎 ^{[2
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机构：

[1] 重庆大学生物工程学院

[2] 四川省农业科学院水稻高粱研究所/农业部西南水稻生物学与遗传育种重点实验室

[3] 国家水稻改良中心泸州分中心

来源：

中国农业科学 | 2013年 / 46卷 / 23期

关键词：

水稻; 穗长; QTL定位;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511.2 [按米的粘性分];

学科分类号：

0901 ;

摘要：

【目的】对水稻F8重组自交系群体穗长QTL进行检测,并比较分析相同亲本衍生的不同群体的遗传图谱、QTL位置、QTL效应的异同,鉴定稳定表达的穗长QTL,以期增加对穗长遗传行为的了解,且有助于通过分子聚合育种手段改良穗长性状。【方法】以籼稻品种泸恢99和粳稻品种日本晴(基因组测序)为亲本构建的F8重组自交系群体中的188个家系为研究材料,利用包含207个标记的遗传连锁图谱,采用基于混合线性模型的QTL定位软件QTLNetwork 2.0,对水稻穗长QTL进行定位和效应分析,并比较分析F8、F2群体的QTL定位和遗传图谱异同。【结果】在F8群体中检测到7个与穗长性状相关的QTL,分别位于第2、3、6、7、8、10染色体上,QTL对表型变异的贡献率为3.38%—14.8%,总贡献率为52.5%。F8、F2群体在5条相同染色体上都定位到了穗长QTL,这些QTL所在标记区间物理位置大部分是重叠和包含关系。F8、F2图谱在定位标记数、标记的位置顺序、遗传距离、平均图距等方面发生了变化。【结论】在F8、F2群体检测到一个稳定遗传的主效应QTL位点,位于第6染色体,并发现了4个尚未报道的穗长QTL。

引用

页码：4849 / 4857

页数：9

共 25 条

[1]

水稻穗长QTL定位.[D].蒋强.重庆大学.2008, 06

[2]

水稻株高和穗长的QTL定位与杂种优势预测.[D].宋佑胜.浙江大学.2001, 01

[3] Identification of quantitative trait loci for yield and yield components in an advanced backcross population derived from the Oryza sativa variety IR64 and the wild relative O-rufipogon [J].

Septiningsih, EM ;

Prasetiyono, J ;

Lubis, E ;

Tai, TH ;

Tjubaryat, T ;

Moeljopawiro, S ;

McCouch, SR .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2003, 107 (08) :1419-1432

[4] Molecular mapping of quantitative trait loci for plant growth, yield and yield related traits across three diverse locations in a doubled haploid rice population [J].

Hittalmani, S ;

Shashidhar, HE ;

Bagali, PG ;

Huang, N ;

Sidhu, JS ;

Singh, VP ;

Khush, GS .

EUPHYTICA, 2002, 125 (02) :207-214

[5] QTL mapping and introgression of yield-related traits from Oryza glumaepatula to cultivated rice (Oryza sativa) using microsatellite markers [J].

Brondani, C ;

Rangel, PHN ;

Brondani, RPV ;

Ferreira, ME .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2002, 104 (6-7) :1192-1203

[6]

Quantitative trait loci for yield and yield components in an Oryza sativa×Oryza rufipogon BC2F2 population evaluated in an upland environment.[J].P. Moncada;C. P. Martínez;J. Borrero;M. Chatel;H. Gauch Jr;E. Guimaraes;J. Tohme;S. R. McCouch.TAG Theoretical and Applied Genetics.2001, 1

[7]

Mapping QTLs with epistatic effects and QTL×environment interactions by mixed linear model approaches.[J].D. L. Wang;J. Zhu;Z. K. L. Li;A. H. Paterson.TAG Theoretical and Applied Genetics.1999, 7-8

[8] MAXIMUM-LIKELIHOOD MODELS FOR MAPPING GENETIC-MARKERS SHOWING SEGREGATION DISTORTION .1. BACKCROSS POPULATIONS [J].