草鱼种质退化相关SRAP分子标记的筛选

被引:7
作者
丁炜东
曹丽萍
曹哲明
机构
[1] 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室
关键词
草鱼; 种质退化; 克隆; 测序; SRAP分子标记;
D O I
暂无
中图分类号
S965.112 [草鱼(鲩)];
学科分类号
090801 ;
摘要
采用相关序列扩增多态性(sequence-realted amplified polymorphism,SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,并筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记。共进行88对引物组合的检测,产生标记数目共计905个。依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出21个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析,发现测得片段中有8个片段能在GeneBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低。
引用
收藏
页码:13 / 17
页数:5
相关论文
共 14 条
[1]   草鱼野生和养殖群体间遗传变异的微卫星分析 [J].
张志伟 ;
曹哲明 ;
杨弘 ;
王金龙 ;
曹谨玲 ;
韩曜平 ;
吴婷婷 .
动物学研究, 2006, (02) :189-196
[2]   长江水系草鱼遗传多样性的微卫星DNA分析 [J].
廖小林 ;
俞小牧 ;
谭德清 ;
童金苟 .
水生生物学报, 2005, (02) :113-119
[3]   伴侣素CCT的结构及与肌动蛋白、微管蛋白的作用机制 [J].
常晓燕 .
国外医学(生理、病理科学与临床分册), 2003, (06) :596-598
[4]   棉花SRAP遗传连锁图构建 [J].
林忠旭 ;
张献龙 ;
聂以春 ;
贺道华 ;
吴茂清 .
科学通报, 2003, (15) :1676-1679
[5]   长江中游水系鲢和草鱼群体mtDNA遗传变异的研究 [J].
张四明 ;
汪登强 ;
邓怀 ;
余来宁 .
水生生物学报, 2002, (02) :142-147
[6]   三江水系草鱼种群RAPD分析 [J].
薛国雄 ;
刘棘 ;
刘洁 .
中国水产科学, 1998, (01) :2-6
[7]   长江鲢、草鱼原种———人繁群体生长差异与生化遗传变化 [J].
杨学明 ;
李思发 .
中国水产科学, 1996, (04)
[8]   浅析“四大家鱼”性状退化的原因及重视种质保护的建议 [J].
廖亚明,刘金炉,汤学林 .
水产科技情报, 1994, (02) :62-63
[9]  
Comparative analysis of seeded and vegetative biotype buffalograsses based on phylogenetic relationship using ISSRs, SSRs, RAPDs, and SRAPs[J] . H. Budak,R. C. Shearman,I. Parmaksiz,I. Dweikat.Theoretical and Applied Genetics . 2004 (2)
[10]   Molecular characterization of Buffalograss germplasm using sequence-related amplified polymorphism markers [J].
Budak, H ;
Shearman, RC ;
Parmaksiz, I ;
Gaussoin, RE ;
Riordan, TP ;
Dweikat, I .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2004, 108 (02) :328-334