嗜肺军团菌微滴式数字PCR检测方法的建立

被引:8
作者
于纪棉 [1 ]
李如松 [2 ]
倪健波 [2 ]
魏姣姣 [2 ]
高峰 [3 ]
王建峰 [2 ]
机构
[1] 宁波卫生职业技术学院
[2] 宁波出入境检验检疫局
[3] 盐城出入境检验检疫局
关键词
嗜肺军团菌; 微滴式数字PCR; 实时荧光定量PCR; 检测;
D O I
暂无
中图分类号
R440 [];
学科分类号
100208 ;
摘要
目的建立嗜肺军团菌微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)检测方法,并与实时荧光定量PCR(realtime fluorescence quantitative PCR,qPCR)技术进行比较。方法针对嗜肺军团菌mip基因设计引物和探针,验证其特异性后,用于ddPCR和qPCR。优化ddPCR的退火温度、引物、探针浓度后,比较ddPCR和qPCR灵敏度和重复性,并对模拟样品进行检测。结果用5株非嗜肺军团菌测试特异性,结果表明具有良好的特异性。ddPCR与qPCR对DNA模板的检测限一致(42.6 fg),模拟样品检出限为300 cfu/ml,ddPCR的线性相关系数(0.999)略优于qPCR(0.982),ddPCR检测的RSD(0.78%14.06%)均高于qPCR(0.30%1.98%)。结论微滴式数字PCR方法灵敏度高、特异性强,可用于嗜肺军团菌检测,且可以对基因进行绝对定量。
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页码:1233 / 1236+1239 +1239
页数:5
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