代谢组学数据分析方法及在糖尿病研究中的应用

被引：31

作者：

董继扬 ^{[1
]}

徐乐 ^{[1
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曹红婷 ^{[1
]}

戴晓侠 ^{[2
]}

李学军 ^{[3
]}

杨叔禹 ^{[3
]}

陈忠 ^{[1
]}

机构：

[1] 厦门大学物理系

[2] 厦门大学医学院

[3] 厦门市第一医院

来源：

波谱学杂志 | 2007年 / 04期

关键词：

基于NMR的代谢组学; 2型糖尿病; 非负矩阵分解; 主成分分析;

D O I：

暂无

中图分类号：

R587.1 [糖尿病];

学科分类号：

100201 [内科学];

摘要：

对NMR波谱数据的统计分析是基于NMR代谢组学研究的关键问题之一.鉴于NMR波谱信号可以近似为样品中各种成分谱信号的线性叠加,本文将非负矩阵分解(NMF)方法引入基于NMR代谢组学的数据处理中,并与代谢组学中常用的统计方法——主成分分析(PCA)进行比较.通过NMF和PCA两种方法对健康志愿者与2型糖尿患者血液和尿液的NMR谱图的统计分析,对所获取的特征代谢物进行比较和验证,并探讨了PCA方法可能存在的不足之处及其原因;阐明了NMF方法是基于NMR的代谢组学研究中较理想的数据分析方法.最后,讨论了基于NMR代谢组学在糖尿病研究中的前景.

引用

页码：381 / 393

页数：13

共 12 条

[1]

基于NMR的代谢组学的数据预处理方法及其在糖尿病研究中的应用 [D].

温锦波 .

厦门大学,

2007

[2]

Nuclear magnetic resonance–determined lipoprotein abnormalities in nonhuman primates with the metabolic syndrome and type 2 diabetes mellitus.[J].Shi-Ying Ding;Xenia T. Tigno;Barbara C. Hansen.Metabolism.2007, 6

[3]

Beyond blood sugar: the potential of NMR-based metabonomics for type 2 human diabetes, and the horse as a possible model [J].