F型、H型居群的铁皮石斛rDNAITS区序列差异及SNP现象的研究

被引:56
作者
丁小余
王峥涛
徐珞珊
徐红
周开亚
施国新
机构
[1] 中国药科大学生药学研究室
[2] 南京师范大学生命科学学院
[3] 南京师范大学生命科学学院 江苏南京南京师范大学生命科学学院
[4] 江苏南京
关键词
铁皮石斛; rDNAITS区; DNA序列; 单核苷酸多态(SNP); 居群差异;
D O I
暂无
中图分类号
R282.5 [药材鉴定];
学科分类号
1008 ;
摘要
目的 :研究铁皮石斛主产区F型和H型居群rDNAITS碱基序列的差异。方法 :运用PCR直接测序法对广西、贵州、云南铁皮石斛主要居群的rDNAITS区 (包括ITS1,5 .8SrDNA ,ITS2 )碱基序列进行了序列测定。结果 :在铁皮石斛各居群中 ,F型居群与H型居群植株的rDNAITS区碱基序列有 2个位点差异 ,且变异分别发生在ITS1区及 5 .8S区内。研究表明 :铁皮石斛居群内部rDNAITS区的差异与植物生活型的差异呈一定的相关性 ,H型居群的铁皮石斛是F型的变种。在F型与H型居群间 ,其 5 .8SrDNA区存在单核苷酸多态 (SNP)现象。首次报道了铁皮石斛ITS区的碱基序列 ,ITS区总长度为 6 34bp ,其中ITS1为 2 31bp ,5 .8S为 16 3bp ,ITS2为 2 4 0bp。结论 :rDNAITS区碱基序列的比较分析进一步证明铁皮石斛F型居群与H型居群间具有显著的差异性。
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