葡萄目标起始密码子多态性反应体系的优化

被引:68
作者
张君玉 [1 ]
郭大龙 [1 ]
龚莹 [1 ]
刘崇怀 [2 ]
李猛 [1 ]
张国海 [1 ]
机构
[1] 河南科技大学林学院
[2] 中国农业科学院郑州果树研究所
关键词
葡萄; SCoT; 正交设计; 单因素试验; 体系优化;
D O I
10.13925/j.cnki.gsxb.2011.02.020
中图分类号
S663.1 [葡萄];
学科分类号
090201 [果树学];
摘要
SCoT标记是一种新型目的基因分子标记方法,采用L16(45)正交试验和单因素试验2种方法优化了葡萄SCoT-PCR反应体系,结果表明正交试验中关键影响因子为dNTPs浓度,单因素试验中为dNTPs和Mg2+浓度。综合2种方法,优化的葡萄SCoT-PCR反应体系为:Mg2+2.0 mmol.L-1、dNTPs 0.3 mmol.L-1、Taq酶1.0 U、引物0.3μmol.L-1、DNA模板30 ng,总体积20μL。扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性1 min,54℃退火1 min,72℃复性2 min,34个循环;最后72℃延伸8 min。该反应体系在20个葡萄品种的验证中表现出良好的稳定性和可重复性,该反应体系的建立为葡萄种质遗传多样性评价、基因组分析、指纹图谱构建、分子标记辅助选择育种等研究提供了新的技术手段。
引用
收藏
页码:209 / 214
页数:6
相关论文
共 10 条
[1]
Start Codon Targeted (SCoT) Polymorphism: A Simple, Novel DNA Marker Technique for Generating Gene-Targeted Markers in Plants [J].
Collard, Bertrand C. Y. ;
Mackill, David J. .
PLANT MOLECULAR BIOLOGY REPORTER, 2009, 27 (01) :86-93
[2]
苹果SRAP-PCR反应体系的建立 [J].
司鹏 ;
戴洪义 ;
薛华柏 ;
张玉刚 ;
郭俊英 ;
曹尚银 .
果树学报, 2010, 27 (02) :168-173
[3]
龙眼SCoT-PCR反应体系的优化 [J].
陈虎 ;
何新华 ;
罗聪 ;
高美萍 ;
朱建华 .
基因组学与应用生物学, 2009, 28 (05) :970-974
[4]
生物技术与葡萄遗传育种 [J].
王军 .
中国农业科学 , 2009, (08) :2862-2874
[5]
目标起始密码子多态性(SCoT):一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术 [J].
熊发前 ;
唐荣华 ;
陈忠良 ;
潘玲华 ;
庄伟建 .
分子植物育种, 2009, 7 (03) :635-638
[6]
SRAP分析体系的优化及在枇杷种质资源研究上的应用 [J].
乔燕春 ;
林顺权 ;
刘成明 ;
杨向晖 .
果树学报, 2008, (03) :348-352
[7]
核桃(Juglans regia)SRAP标记反应体系建立的研究 [J].
马明 ;
杨克强 ;
刘晓菊 ;
孙明高 ;
郭起荣 .
山东农业大学学报(自然科学版), 2007, (02) :189-192
[8]
辣椒SRAP-PCR反应体系的建立与优化 [J].
任羽 ;
王得元 ;
张银东 ;
李颖 ;
王恒明 .
分子植物育种, 2004, (05) :689-693
[9]
正交设计直观分析法优化PCR条件 [J].
何正文 ;
刘运生 ;
陈立华 ;
曹美鸿 ;
夏家辉 .
湖南医科大学学报, 1998, (04)
[10]
葡萄无核基因的RAPD遗传标记 [J].
王跃进 ;
LamikanraO ;
卢江 ;
RammingD .
西北农业大学学报, 1996, (05)