目的分析2008—2009年北京市沙门菌流行特征及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。方法 对2008—2009年通过WHO全球沙门菌监测系统及北京市肠道门诊监测系统分离到的137株沙门菌进行生化鉴定、血清分型和相关流行病学分析;利用PFGE进行分子分型。结果北京市2008—2009年沙门菌的流行具有明显季节性,6—9月份高发,共分离菌株84株,占64.1%(84/131);患者年龄多为18~40岁,占46.1%(58/128);男性80例,女性51例,男女比例为1.57:1。137株沙门菌分属于20种血清型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势菌型,分别占46.7%(64/137)和17.5%(24/137)。共分71种PFGE带型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌都有16种PFGE型别。肠炎沙门菌的4种PFGE型别(JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0003、JEGX01.CN0002、JEGX01.CN0019)和鼠伤寒沙门菌的JPXX01.CN0001为优势分子型别。结论 2008—2009年北京市沙门菌的流行具有性别、年龄和季节性分布特征;PFGE分子型别较多,且存在差异明显的多个克隆系。