芒果SRAP-PCR反应体系的优化与退火温度的筛选

被引:5
作者
付海天 [1 ,2 ]
赵英 [1 ]
机构
[1] 广西亚热带作物研究所
[2] 广西木薯研究所
关键词
芒果; SRAP; 体系优化; 引物筛选; 退火温度;
D O I
10.19303/j.issn.1008-0384.2014.04.010
中图分类号
S667.7 [芒果];
学科分类号
090201 ;
摘要
以芒果为材料,通过单因子模板DNA含量、引物含量、2×Taq PCR Master Mix含量3种因素水平进行试验,建立了SRAP反应的优化体系。结果表明:最佳反应体系为20μL,包括24ng模板DNA,8pmL引物,2×Taq PCR Master Mix 10.0μL。该体系对芒果扩增效果好,电泳结果显示扩增条带清晰,多态性高,而且操作简单。从81对引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的29对引物组合。在此基础上对退火温度进行探索,发现扩增结果对退火温度变化不敏感。
引用
收藏
页码:345 / 349
页数:5
相关论文
共 8 条
[1]   广西主要杧果资源遗传关系的SSR分析 [J].
王静毅 ;
王家保 ;
武耀廷 ;
黄国弟 ;
周俊岸 ;
李日旺 .
热带作物学报, 2009, 30 (09) :1301-1307
[2]   均匀设计优化野生狗牙根的SRAP-PCR反应体系 [J].
朱红霞 ;
胡利宗 ;
邓小莉 .
中国农学通报, 2009, 25 (18) :41-46
[3]   樱桃SRAP-PCR体系优化及其遗传多样性分析 [J].
路娟 ;
张绍铃 ;
刘庆忠 ;
吴俊 ;
张瑞萍 ;
廖杨文科 ;
陈婷 .
果树学报, 2009, 26 (02) :163-169
[4]   番茄SRAP-PCR体系优化与品种分子鉴定 [J].
王燕 ;
龚义勤 ;
赵统敏 ;
刘广 ;
郁樊敏 ;
叶海龙 ;
柳李旺 .
南京农业大学学报, 2007, (01) :23-29
[5]   SRAP、ISSR技术的优化及在甘蓝类植物种子鉴别中的应用 [J].
刘冲 ;
葛才林 ;
任云英 ;
陈锦秀 ;
杨晓锋 ;
薄天岳 .
生物工程学报, 2006, (04) :657-661
[6]   我国芒果选育种研究现状及发展趋势 [J].
黄国弟 .
中国果树, 2000, (03) :50-52
[7]  
Comparative analysis of seeded and vegetative biotype buffalograsses based on phylogenetic relationship using ISSRs, SSRs, RAPDs, and SRAPs[J] . H. Budak,R. C. Shearman,I. Parmaksiz,I. Dweikat.Theoretical and Applied Genetics . 2004 (2)
[8]  
Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica[J] . G. Li,C. F. Quiros.TAG Theoretical and Applied Genetics . 2001 (2-3)