均匀设计优化野生狗牙根的SRAP-PCR反应体系

被引:11
作者
朱红霞 [1 ]
胡利宗 [2 ]
邓小莉 [1 ]
机构
[1] 新乡学院
[2] 河北农业大学
关键词
野生狗牙根; 均匀设计; SRAP-PCR; 体系优化;
D O I
暂无
中图分类号
S688.4 [草坪与地被植物];
学科分类号
090706 ;
摘要
采用均匀设计方法,对影响野生狗牙根SRAP-PCR体系的MgCl2、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶和模板浓度等进行了U16(45)和U12(35)两轮优化,建立了适用于野生狗牙根的SRAP-PCR反应体系。该优化的25μl反应体系包含MgCl23.5mmol/L,dNTPs0.20nmol/L,引物0.44μmol/L,Taq DNA聚合酶1.50U,模板28ng/L。在此基础上又对退火温度进行了摸索,结果发现扩增结果对退火温度变化不敏感。最后运用优化体系对来自不同地区的10份野生狗牙根的16个单株的DNA进行扩增验证,结果获得的DNA条带清晰,多态性比较丰富。说明该优化的SRAP-PCR体系可用于野生狗牙根不同种间亲缘关系、系统进化和遗传多样性等领域的研究。
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