樱桃SRAP-PCR体系优化及其遗传多样性分析

被引：29

作者：

路娟 ^{[1
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张绍铃 ^{[1
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刘庆忠 ^{[2
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吴俊 ^{[1
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张瑞萍 ^{[1
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廖杨文科 ^{[1
]}

陈婷 ^{[1
]}

机构：

[1] 南京农业大学园艺学院

[2] 山东省果树研究所

来源：

果树学报 | 2009年 / 26卷 / 02期

基金：

中国博士后科学基金;

关键词：

樱桃; SRAP; 体系优化; 遗传多样性;

D O I：

10.13925/j.cnki.gsxb.2009.02.012

中图分类号：

S662.5 [樱桃];

学科分类号：

090201 ;

摘要：

选取亲缘关系较远的3个不同基因型樱桃资源为试材,对影响SRAP标记PCR反应的模板、Mg2+、dNTPs、Taq酶及引物浓度进行了优化,建立了适合于樱桃SRAP标记的扩增体系。反应体系具体为:模板DNA75ng,dNTPs0.2mmol·L-1,Mg2+2.5mmol·L-1,引物0.3μmol·L-1,Taq酶1.0U,反应总体积20μL。采用优化的扩增体系,对45个樱桃种质材料进行了遗传多样性分析,筛选8对扩增清晰且多态性高的引物组合,检测位点共227个,其中多态性位点192个,占84.6%。应用NTSYS-pc软件进行聚类分析(UPGMA),结果表明45个樱桃品种可分为欧洲甜樱桃和中国樱桃2大类,品种间遗传相似系数在0.52～0.98;其中中国樱桃与甜樱桃种间的相似系数最小,表明2类种质具有不同的遗传背景;而组群内的不同品种资源表现了较高的遗传相似性。SRAP分子标记的聚类分析揭示了樱桃品种间亲缘关系与地理分布以及来源相关。

引用

页码：163 / 169

页数：7

共 17 条

[1] 海岛棉遗传多样性的SRAP标记分析 [J].

李武 ;

倪薇 ;

林忠旭 ;

张献龙 .

作物学报, 2008, (05) :893-898

[2] 柑桔SRAP和ISSR分子标记技术体系的建立与优化 [J].

吴鑫 ;

雷天刚 ;

何永睿 ;

刘小丰 ;

许兰珍 ;

彭爱红 ;

陈善春 .

分子植物育种, 2008, (01) :170-176

[3] 梨SRAP-PCR反应体系的建立与优化 [J].

张妤艳 ;

吴俊 ;

张绍铃 .

农业生物技术学报, 2007, (05) :909-910

[4] 用微卫星标记研究樱桃品种间的亲缘关系(英文) [J].

艾呈祥 ;

辛力 ;

张力思 ;

魏海蓉 ;

苑克俊 ;

孙清荣 ;

金松南 ;

刘庆忠 .

果树学报, 2007, (04) :460-465

[5] 核桃(Juglans regia)SRAP标记反应体系建立的研究 [J].

马明 ;

杨克强 ;

刘晓菊 ;

孙明高 ;

郭起荣 .

山东农业大学学报(自然科学版), 2007, (02) :189-192

[6] SRAP与TRAP标记及其在园艺植物研究中的应用 [J].

李莉 ;

彭建营 ;

白瑞霞 ;

韩斌 .

西北植物学报, 2006, (08) :1749-1752

[7] 甜樱桃品种及其砧木的RAPD分析 [J].

蔡宇良 ;

曹东伟 ;

李珊 ;

钱增强 ;

赵桂仿 .

西北植物学报, 2006, (06) :1125-1132

[8] 部分柿属植物SRAP-PCR反应体系的优化 [J].

郭大龙 ;

罗正荣 .

果树学报, 2006, (01) :138-141

[9] 樱桃品种资源间遗传差异的RAPD分析 [J].

王彩虹 ;

田义轲 ;

赵静 ;

戴洪义 ;

王东 .

西北植物学报, 2005, (12) :2431-2435

[10] 15个樱桃品种的RAPD分析 [J].

陈晓流 ;

陈学森 ;

束怀瑞 ;

许衡 .

果树学报, 2004, (06) :556-559

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