崇明东滩夏冬季表层沉积物细菌多样性研究

被引：23

作者：

郑艳玲 ^{[1
]}

侯立军 ^{[2
]}

陆敏 ^{[1
]}

刘敏 ^{[1
]}

谢冰 ^{[1
]}

李勇 ^{[1
]}

赵慧 ^{[3
]}

机构：

[1] 华东师范大学资源与环境科学学院

[2] 华东师范大学河口海岸学国家重点实验室

[3] 上海植物园科研中心

来源：

中国环境科学 | 2012年 / 32卷 / 02期

关键词：

沉积物; 细菌; 多样性; 16SrRNA; PCR; 克隆; 长江口;

D O I：

暂无

中图分类号：

X172 [环境微生物学];

学科分类号：

071012 ; 0713 ;

摘要：

以长江口崇明东滩高、中、低潮滩夏、冬两季表层沉积物中基因组DNA为模板,PCR扩增样品中细菌16S rRNA基因V3区片段,通过克隆、测序,构建相应基因文库.系统发育分析结果表明,崇明东滩高、中、低潮滩表层沉积物共包含12个主要门类的细菌:变形菌门(Proteobacteria)(α-、β-、γ-、δ-和ε-亚群)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、螺旋体门(Spirochaetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、浮霉菌门(Planctomycetes)、绿菌门(Chlorobi)、网团菌门(Dictyoglomi)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae),此外还存在大量未被认知的序列.中潮滩和低潮滩的优势菌为变形菌,高潮滩的优势菌为拟杆菌.DOTUR多样性分析结果表明,崇明中潮滩细菌多样性最高,低潮滩次之,高潮滩最低;夏季细菌多样性高于冬季.夏、冬两季细菌群落差异高潮滩最大,低潮滩次之,中潮滩最小.

引用

页码：300 / 310

页数：11

共 16 条

[1] 内蒙古退化荒漠草原土壤细菌群落结构特征 [J].