东北太平洋深海沉积物细菌多样性

被引：13

作者：

徐宏翔 ^{[1
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吴敏 ^{[2
]}

王小谷 ^{[1
]}

杨俊毅 ^{[1
]}

王春生 ^{[1
]}

机构：

[1] 国家海洋局第二海洋研究所

[2] 浙江大学

来源：

生态学报 | 2008年 / 02期

关键词：

多金属结核合同区; 深海沉积物; 细菌多样性; 16SrRNA;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q938 [微生物生态学和地区分布];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

采用两种方法提取中国结核合同区东区沉积物不同层次总DNA,通过克隆测序构建了含有79个克隆子的细菌16S rRNA基因文库,分析了该海域沉积物中细菌的多样性。79个克隆在系统发育树中形成了11个大分支,包括Gamma proteobacteria(22.8%),Alpha proteobacteria(16.5%),Planctomycetacia(7.6%),Delta proteobacteria(6.3%),Nitrospira(6.3%),Actinobacteria(6.3%),Beta proteobacteria(5%),Acidobacteria(5.1%),Sphingobacteria(3.8%),Firmicutes(2.5%),Other bacteria(17.7%),其中Gamma proteobacteria在总文库中所占比例最高,该分支细菌在0～2cm、4～6cm层也是优势菌种。Gamma proteobacteria中假单胞菌(Pseudomonas)为优势属(22.2%)。各个层次中所含细菌类群有所不同,Alpha proteobacteria、Gamma proteobacteria、Deltaproteobacteria、Planctomycetacia、Nitrospira、Actinobacteria和Acidobacteria为三层样品共有类群。

引用

页码：479 / 485

页数：7

共 8 条

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