青岛、威海水域夏冬季表层沉积物细菌多样性的初步研究

被引:13
作者
肖慧 [1 ]
张艳 [1 ]
张喆 [2 ,1 ]
朱琳 [1 ]
游偲 [1 ]
唐学玺 [1 ]
机构
[1] 中国海洋大学海洋生命学院
[2] 中国水产科学研究院黄海水产研究所
关键词
沉积物; 16SrDNA; 细菌; 多样性; 青岛; 威海;
D O I
10.16441/j.cnki.hdxb.2009.04.015
中图分类号
Q938 [微生物生态学和地区分布];
学科分类号
071005 ; 100705 ;
摘要
以青岛、威海水域夏冬两季表层沉积物中的基因组DNA为模板,扩增沉积物样品中细菌的16S rDNA片段,并构建其相应文库。进行16S rDNA序列分析,并与数据库中的序列进行比对。分析结果表明:2个站位沉积物样品细菌分别属于11个主要细菌门类,包括:变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Plancomycene)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、硝化螺菌门(Nitrospirae)、疣微菌门(Verrucomicrobial)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿屈挠菌门(Chlo-roflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、高G+C含量革兰氏阳性菌放线菌门(Actinobacteria)和低G+C含量革兰氏阳性菌梭菌门(Clostridiales)。其中变形菌门是主要类群,且γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)占优势。与QD2站位相比,QD1站位沉积物细菌多样性随季节变化不大。
引用
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