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青岛、威海水域夏冬季表层沉积物细菌多样性的初步研究
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肖慧
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机构:
张艳
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张喆
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朱琳
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游偲
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唐学玺
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中国海洋大学海洋生命学院
中国海洋大学海洋生命学院
唐学玺
[
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机构
:
[1]
中国海洋大学海洋生命学院
[2]
中国水产科学研究院黄海水产研究所
来源
:
中国海洋大学学报(自然科学版)
|
2009年
/ 39卷
/ 04期
关键词
:
沉积物;
16SrDNA;
细菌;
多样性;
青岛;
威海;
D O I
:
10.16441/j.cnki.hdxb.2009.04.015
中图分类号
:
Q938 [微生物生态学和地区分布];
学科分类号
:
071005 ;
100705 ;
摘要
:
以青岛、威海水域夏冬两季表层沉积物中的基因组DNA为模板,扩增沉积物样品中细菌的16S rDNA片段,并构建其相应文库。进行16S rDNA序列分析,并与数据库中的序列进行比对。分析结果表明:2个站位沉积物样品细菌分别属于11个主要细菌门类,包括:变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Plancomycene)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、硝化螺菌门(Nitrospirae)、疣微菌门(Verrucomicrobial)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿屈挠菌门(Chlo-roflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、高G+C含量革兰氏阳性菌放线菌门(Actinobacteria)和低G+C含量革兰氏阳性菌梭菌门(Clostridiales)。其中变形菌门是主要类群,且γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)占优势。与QD2站位相比,QD1站位沉积物细菌多样性随季节变化不大。
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相关论文
共 18 条
[1]
胶州湾和东太平洋海隆(~13°N)沉积物微生物多样性研究.[D].李友训.中国科学院研究生院(海洋研究所).2008, 09
[2]
东太平洋结核区细菌调查及鉴定
[J].
张海艳
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机构:
厦门大学生命科学学院
厦门大学生命科学学院
张海艳
;
论文数:
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机构:
王风平
.
厦门大学学报(自然科学版),
2006,
(S1)
:267
-271
[3]
南海西沙海槽沉积物细菌多样性初步研究
[J].
论文数:
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机构:
李涛
;
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机构:
王鹏
;
汪品先
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机构:
同济大学海洋地质国家重点实验室
汪品先
.
地球科学进展,
2006,
(10)
:1058
-1062
[4]
太平洋帕里西维拉海盆细菌多样性的非培养的初步分析
[J].
谢华
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中国科学院微生物研究所
谢华
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薛燕芬
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中国科学院微生物研究所
薛燕芬
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赵爱民
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中国科学院微生物研究所
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李铁钢
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马延和
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中国科学院微生物研究所
马延和
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曾艳
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中国科学院微生物研究所
曾艳
.
微生物学报,
2005,
(01)
:1
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[5]
海洋微生物多样性研究进展
[J].
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机构:
薛超波
;
王国良
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宁波大学生命科学与生物工程学院
王国良
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金珊
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宁波大学生命科学与生物工程学院
金珊
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郑天伦
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宁波大学生命科学与生物工程学院
郑天伦
.
海洋科学进展,
2004,
(03)
:377
-384
[6]
西太平洋“暖池”区沉积物中的细菌类群及其与环境的关系
[J].
曾润颖
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国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所厦门,厦门,厦门,厦门
曾润颖
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赵晶
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国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所厦门,厦门,厦门,厦门
赵晶
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张锐
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国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所厦门,厦门,厦门,厦门
张锐
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林念炜
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国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所厦门,厦门,厦门,厦门
林念炜
.
中国科学(D辑:地球科学),
2004,
(03)
:265
-271
[7]
南沙海区沉积物中细菌和古细菌16S rDNA多样性的研究
[J].
许飞
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许飞
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戴欣
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陈月琴
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周惠
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蔡剑华
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屈良鹄
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中山大学基因工程教育部重点实验室
屈良鹄
.
海洋与湖沼,
2004,
(01)
:89
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[8]
深海沉积物样品中古菌的16S rDNA分析
[J].
徐美香
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厦门大学生命科学学院,国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室厦门国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,厦门,厦门国家海洋局第三海洋研究所,厦门,厦门国家海洋局第三海洋研究所,厦门
徐美香
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王风平
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厦门大学生命科学学院,国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室厦门国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,厦门,厦门国家海洋局第三海洋研究所,厦门,厦门国家海洋局第三海洋研究所,厦门
王风平
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肖湘
.
自然科学进展,
2003,
(06)
:40
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中国南海南沙海区沉积物中细菌16S rDNA多样性的初步研究
[J].
戴欣
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中山大学生命科学学院,基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院,基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院,基因工程教育部重点实验室,中国科学院南海海洋研究所,中国科学院南海海洋研究所,中山大学生命科学学院,基因工程教育部重点实验室,中山大学生命科学学院,基因工程教育部重点实验室广州,广州,广州,广州,广州,广州,广州
戴欣
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周惠
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陈月琴
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周毅频
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周世宁
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屈良鹄
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屈良鹄
.
自然科学进展,
2002,
(05)
:33
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[10]
海洋沉积物中特有细菌类群的初步探讨
[J].
戴欣
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中山大学学报(自然科学版),
2001,
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[1]
胶州湾和东太平洋海隆(~13°N)沉积物微生物多样性研究.[D].李友训.中国科学院研究生院(海洋研究所).2008, 09
[2]
东太平洋结核区细菌调查及鉴定
[J].
张海艳
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厦门大学生命科学学院
厦门大学生命科学学院
张海艳
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王风平
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厦门大学学报(自然科学版),
2006,
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[3]
南海西沙海槽沉积物细菌多样性初步研究
[J].
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汪品先
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地球科学进展,
2006,
(10)
:1058
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[4]
太平洋帕里西维拉海盆细菌多样性的非培养的初步分析
[J].
谢华
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薛燕芬
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微生物学报,
2005,
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[5]
海洋微生物多样性研究进展
[J].
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王国良
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王国良
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金珊
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郑天伦
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海洋科学进展,
2004,
(03)
:377
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[6]
西太平洋“暖池”区沉积物中的细菌类群及其与环境的关系
[J].
曾润颖
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国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所,国家海洋局海洋生物工程重点实验室,国家海洋局第三海洋研究所厦门,厦门,厦门,厦门
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林念炜
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中国科学(D辑:地球科学),
2004,
(03)
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[7]
南沙海区沉积物中细菌和古细菌16S rDNA多样性的研究
[J].
许飞
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中山大学基因工程教育部重点实验室
屈良鹄
.
海洋与湖沼,
2004,
(01)
:89
-94
[8]
深海沉积物样品中古菌的16S rDNA分析
[J].
徐美香
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厦门大学生命科学学院,国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室厦门国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,厦门,厦门国家海洋局第三海洋研究所,厦门,厦门国家海洋局第三海洋研究所,厦门
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王风平
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肖湘
.
自然科学进展,
2003,
(06)
:40
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[9]
中国南海南沙海区沉积物中细菌16S rDNA多样性的初步研究
[J].
戴欣
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屈良鹄
.
自然科学进展,
2002,
(05)
:33
-38
[10]
海洋沉积物中特有细菌类群的初步探讨
[J].
戴欣
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中山大学学报(自然科学版),
2001,
(06)
:51
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